带有命令行参数的默认R输出

Question

我试图提供一种通过Rscript运行无人看管的R脚本的方法。我遇到的问题是图形的默认输出是 current 目录中的PDF文件。我想将此输出重定向到一个单独的文件夹，但不必过多更改脚本。

如果我的脚本很简单，例如：

args = commandArgs(trailingOnly = TRUE)

mydata <- get some data frame somehow
plot(tayside)

然后执行以下命令行：

Rscript.exe --vanilla --default-packages=RODBC,graphics,grDevices sample.R > C:\temp\sample.Rout

我在当前文件夹中得到一个Rplots.pdf，在sample.Rout文件夹中得到了一个C:\temp\文件。

是否可以指定输出文件夹并将Rscript的所有输出放在那里？我尝试使用pdf.options(...)将默认文件夹添加到file参数的前面，但是没有办法。

Answer 1

好吧，显然比我想象的要容易，不需要使用pdf.options()，而只需在文件顶部使用pdf()（在获取参数之后）：

pdf(paste0(args[1], "MyFile.pdf"))

或者，对于多个文件：

pdf(paste0(args[1], "MyFile%03d.pdf"), onefile=FALSE)