如何从核苷酸生成IUPAC代码？

Question

我想找到相当于2个不同核苷酸的IUPAC。

示例：我有A和C，我想要M。 或者：我有R和T，我想要D。

在Biopython中是否有这样做的方法？ （这听起来很简单，但我只找到了使用对齐方式来做到这一点的方法，这对我而言不合适。）

谢谢！

Answer 1

我认为您正在寻找Bio.Data.IUPACData中的字典，例如：

>>> from Bio.Data import IUPACData
>>> d = {v:k for k,v in IUPACData.ambiguous_dna_values.items()}
>>> d['AC']
'M'

请注意，此处反转字典映射意味着我们丢失了一个密钥，因为'X'和'N'都映射到'GATC'。