我有3个未知基因组，我有15个基因组（细菌5个，真菌5个，酵母5个）。我发现所有这些基因组都有双重组合。双重组合为AA，AT，AG，AC，...（16个组合）。然后，我发现了它们在基因组中的百分比。最后，我从细菌，真菌和酵母菌中获得了3个参考平均百分比值，我想将这些百分比值与3个未知基因组百分比进行比较。顺便说一下，我可以定义哪个基因组属于哪个家族。我该怎么办，是否有任何包装可以执行这些操作？
例如，我的test1percentages如下；
>0.09583437 -- 0.05393204 -- 0.06488782 -- 0.07903921 -- 0.06890654 -- 0.04395304 -- 0.02788807
0.06502646 -- 0.06932366 -- 0.03773925 -- 0.04409289 -- 0.05457230 -- 0.05962886 -- 0.07014978
0.06885963 -- 0.09616608
我有细菌，真菌，酵母菌百分比；
>allbacs
0.05421850 -- 0.05540724 -- 0.05065422 -- 0.05524792 -- 0.06539913 --
0.07254104 -- 0.09583958
0.05023776 -- 0.05921741 -- 0.09700061 -- 0.07263406 -- 0.05576768 --
0.03669278 -- 0.05906868 --
0.06549191 -- 0.05458147
>allyeasts
0.08239379 -- 0.05602528 -- 0.05407910 -- 0.07096754 -- 0.05685478 -- 0.05165226 -- 0.04809652
0.06476042 -- 0.06680492 -- 0.04832589 -- 0.04111317 -- 0.05642334 --
0.05840699 -- 0.06536005 --
0.06937911 -- 0.10935685
>allfungus
0.08458809 -- 0.05068602 -- 0.07291263 -- 0.07811563 -- 0.04697502 --
0.05680199 -- 0.04689305
0.06906349 -- 0.05600454 -- 0.05504048 -- 0.04973311 -- 0.05383871 --
0.09893712 -- 0.05720541
0.04476084 -- 0.07844389
（Test1属于真菌）
如何比较它们的相似性？我试图对它们进行绘图和评论，但是教授说这应该是自动的。
谢谢