向前填充列具有基于索引的限制

时间:2019-01-25 01:23:46

标签: python pandas dataframe pandas-groupby imputation

我想向前填充一列,并希望指定一个限制,但是我希望该限制基于索引-而不是像limit允许的那样简单的行数。

例如,假设我具有以下数据框:

df = pd.DataFrame({
    'data': [0.0, 1.0, np.nan, 3.0, np.nan, 5.0, np.nan, np.nan, np.nan, np.nan],
    'group': [0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1]
})

看起来像

In [27]: df
Out[27]:
   data  group
0   0.0      0
1   1.0      0
2   NaN      0
3   3.0      1
4   NaN      1
5   5.0      0
6   NaN      0
7   NaN      0
8   NaN      1
9   NaN      1

如果我按group列分组并用limit=2向前填充该组,那么我得到的数据帧将是

In [35]: df.groupby('group').ffill(limit=2)
Out[35]:
   group  data
0      0   0.0
1      0   1.0
2      0   1.0
3      1   3.0
4      1   3.0
5      0   5.0
6      0   5.0
7      0   5.0
8      1   3.0
9      1   NaN

但是,我实际上要做的只是向前填充到其索引位于每个组的第一个索引距2之内的行中,而不是每个组的下2个行。例如,如果我们只看数据框上的组:

In [36]: for i, group in df.groupby('group'):
    ...:     print(group)
    ...:
   data  group
0   0.0      0
1   1.0      0
2   NaN      0
5   5.0      0
6   NaN      0
7   NaN      0
   data  group
3   3.0      1
4   NaN      1
8   NaN      1
9   NaN      1

我希望这里的第二组仅向前填充到索引4--而不是8和9。第一组的NaN值都位于最后一个非NaN值的2个索引之内,因此它们将被完全填充。生成的数据框如下所示:

   group  data
0      0   0.0
1      0   1.0
2      0   1.0
3      1   3.0
4      1   3.0
5      0   5.0
6      0   5.0
7      0   5.0
8      1   NaN
9      1   NaN

在我的实际用例中,FWIW的索引是DateTimeIndex(并且已排序)。

我目前有一种解决方案,需要循环遍历在组索引上过滤的数据框,为每个事件创建一个时间范围,并基于该索引使用非NaN值,然后将它们组合起来。但这太慢了,无法实现。

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

import numpy as np
import pandas as pd
df = pd.DataFrame({
    'data': [0.0, 1.0, 1, 3.0, np.nan, 22, np.nan, 5, np.nan, np.nan],
    'group': [0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1]})

df = df.reset_index()
df['stop_index'] = df['index'] + 2
df['stop_index'] = df['stop_index'].where(pd.notnull(df['data']))
df['stop_index'] = df.groupby('group')['stop_index'].ffill()
df['mask'] = df['index'] <= df['stop_index']
df.loc[df['mask'], 'data'] = df.groupby('group')['data'].ffill()
print(df)
#    index  data  group  stop_index   mask
# 0      0   0.0      0         2.0   True
# 1      1   1.0      0         3.0   True
# 2      2   1.0      1         4.0   True
# 3      3   3.0      0         5.0   True
# 4      4   1.0      1         4.0   True
# 5      5  22.0      0         7.0   True
# 6      6   NaN      1         4.0  False
# 7      7   5.0      0         9.0   True
# 8      8   NaN      1         4.0  False
# 9      9   NaN      1         4.0  False

# clean up df
df = df[['data', 'group']]
print(df)

收益

   data  group
0   0.0      0
1   1.0      0
2   1.0      1
3   3.0      0
4   1.0      1
5  22.0      0
6   NaN      1
7   5.0      0
8   NaN      1
9   NaN      1

这会将索引复制到列中,然后 制作第二个stop_index列,其中index的大小增加了 (时间)窗口。

df = df.reset_index()
df['stop_index'] = df['index'] + 2

然后,它在stop_index中创建空行以匹配data中的空行:

df['stop_index'] = df['stop_index'].where(pd.notnull(df['data']))

然后按组逐个填充stop_index

df['stop_index'] = df.groupby('group')['stop_index'].ffill()

现在(最后),我们可以定义所需的mask了-我们实际要向前填充data的地方:

df['mask'] = df['index'] <= df['stop_index']
df.loc[df['mask'], 'data'] = df.groupby('group')['data'].ffill()

答案 1 :(得分:3)

IIUC

l=[]
for i, group in df.groupby('group'):
    idx=group.index
    l.append(group.reindex(df.index).ffill(limit=2).loc[idx])

pd.concat(l).sort_index()
   data  group
0   0.0    0.0
1   1.0    0.0
2   1.0    0.0
3   3.0    1.0
4   3.0    1.0
5   5.0    0.0
6   5.0    0.0
7   5.0    0.0
8   NaN    1.0
9   NaN    1.0

测试数据

   data  group
0   0.0      0
1   1.0      0
2   1.0      1
3   3.0      0
4   NaN      1
5   22       0
6   NaN      1
7   5.0      0
8   NaN      1
9   NaN      1

我的数据测试方法

   data  group
0   0.0    0.0
1   1.0    0.0
2   1.0    1.0
3   3.0    0.0
4   1.0    1.0
5  22.0    0.0
6   NaN    1.0# here not change , since the previous two do not have valid value for group 1 
7   5.0    0.0
8   NaN    1.0
9   NaN    1.0

与unutbu放在一起

   data  group
0   0.0      0
1   1.0      0
2   1.0      1
3   3.0      0
4   1.0      1
5  22.0      0
6   1.0      1# miss match in here
7   5.0      0
8   NaN      1
9   NaN      1