如何从R中的多个（数千个）netcdf文件写入单个CSV文件

Question

我正在尝试从数千个netcdf文件中获取单个csv文件，其中每个文件都代表一个时间点。这些文件包含时间，纬度，经度和4个不同的天气变量。我的想法是将文件合并到一个netcdf文件中，然后我可以从中写入一个csv文件，但是我不确定如何用简单的代码合并29000个文件而不必一遍又一遍地写文件名。

Answer 1

使用netCDF运算符。 cdo或nco。

要与cdo及时合并文件，只需：

cdo mergetime input_files output_file

并使用nco（根据https://linux.die.net/man/1/ncrcat）：

ncrcat input_files outputfile

您可以使用通配符input_files指定*。基本上，如果您成千上万的文件被命名为：file_000001.nc，file_000002.nc，...，file_vwxyz.nc，请执行：

cdo mergetime file_* files.nc

另一种方法是循环遍历文件名，并使用r或使用的任何工具进行所有操作。但是，cdo或nco是解决问题的正确工具。