Question

我有一个file.txt，其中包含很多行，例如：:

blastdbcmd -db /path/path/LO/db_lh/makedb_KO -entry scaffold_2731 -range 32270-32509-strand minus >> file.fst
blastdbcmd -db /path/path/LO/db_lh/makedb_lKO -entry scaffold_2781 -range 3230-3508-strand minus >> file.fst
etc.

我想用file.fst替换所有path/data/path/LO/file.txt模式

然后得到：

blastdbcmd -db /path/path/LO/db_lh/makedb_KO -entry scaffold_2731 -range 32270-32509-strand minus >> path/data/path/LO/file.txt
blastdbcmd -db /path/path/LO/db_lh/makedb_lKO -entry scaffold_2781 -range 3230-3508-strand minus >> path/data/path/LO/file.txt

etc.

它尝试过：

sed -i -e 's/file.fst/path/data/path/LO/file.txt/g' /path/path/file_script_recover_copie.txt

但是它不起作用，有人有更好的主意吗？谢谢。

Answer 1

备份文件，然后尝试以下操作：

sed -i -e 's@file.fst@path/data/path/LO/file.txt@g' /path/path/file_script_recover_copie.txt

例如：

$ cat file
blastdbcmd -db /path/path/LO/db_lh/makedb_KO -entry scaffold_2731 -range 32270-32509-strand minus >> file.fst
blastdbcmd -db /path/path/LO/db_lh/makedb_lKO -entry scaffold_2781 -range 3230-3508-strand minus >> file.fst
etc.

$ sed -e 's@file.fst@path/data/path/LO/file.txt@g' file
blastdbcmd -db /path/path/LO/db_lh/makedb_KO -entry scaffold_2731 -range 32270-32509-strand minus >> path/data/path/LO/file.txt
blastdbcmd -db /path/path/LO/db_lh/makedb_lKO -entry scaffold_2781 -range 3230-3508-strand minus >> path/data/path/LO/file.txt
etc.

问题是因为替换项中有/，其中/也是sed的{{1}}分隔符。但是s可以使用其他字符作为sed的定界符。所以我将其更改为s。
（您也可以使用其他人，只要他们在正确的位置即可）

另一种方法是通过在@前面加上/来逃逸\，因此在s内部，它们变成\/. (This applies to other special characters too, for example to use'you can put \'`。）

Answer 2

如果您对awk表示满意，则可以尝试关注。

awk -v val="path/data/path/LO/file.txt" '{sub("file.fst",val)} 1' Input_file

将路径的值传递到-v val的{{1}}变量，然后它应该起作用。

使用awk来防止定界符保留为sed本身，然后尝试执行以下操作。（我在/解决方案中转义了\/，因此不会考虑它因为它用于关闭sed的代码段）

sed

使用/通过路径模式更改模式

2 个答案: