Question

Bokeh和networkx在其文档中使用的示例正在运行。我不知道他们使用的数据，因此我使用的是我在下面找到并显示的“空手道俱乐部”数据。我不能认为这是相同的数据。我从json文件中读取数据。

unnest

nx.set_node_attributes（G，nd_attrs，“ g_color”）

IN_LIST，NOT_IN_LIST =“红色”，“灰色” 对于start_node，end_node，_在G.edges中（data = True）：如果lst_big_nodes中的start_node：＃或lst_big_nodes中的end_node： edge_color = IN_LIST
其他： edge_color = NOT_IN_LIST edge_attrs [（start_node，end_node）] = edge_color

library(tidyverse)
iris %>% 
  group_by(Species) %>% 
  nest %>%
  mutate(data = map(data, ~ .x %>% 
                              select_if(is.numeric) %>% 
                              mutate(Count = sum(rowSums(.))))) %>% 
                              #or use reduce with sum
                              # mutate(Count = reduce(., `+`) %>% sum))) %>%
  unnest 
# A tibble: 150 x 6
#   Species Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Count
#   <fct>          <dbl>       <dbl>        <dbl>       <dbl> <dbl>
# 1 setosa           5.1         3.5          1.4         0.2  507.
# 2 setosa           4.9         3            1.4         0.2  507.
# 3 setosa           4.7         3.2          1.3         0.2  507.
# 4 setosa           4.6         3.1          1.5         0.2  507.
# 5 setosa           5           3.6          1.4         0.2  507.
# 6 setosa           5.4         3.9          1.7         0.4  507.
# 7 setosa           4.6         3.4          1.4         0.3  507.
# 8 setosa           5           3.4          1.5         0.2  507.
# 9 setosa           4.4         2.9          1.4         0.2  507.
#10 setosa           4.9         3.1          1.5         0.1  507.
# ... with 140 more rows

我得到了错误：

nx.set_edge_attributes（G，edge_attrs，“ edge_color”）

用于（u，v，键），values.items（）中的值： ValueError：没有足够的值可解压缩（预期3，得到2）

我确实尝试了很多不同的香草口味，而没有任何适用于边缘颜色的代码。我丢失了一些东西，但看不到。谢谢您的帮助。

函数read_json_file来自read json graph networkx file

Bokeh networkx doc:

这是来自“空手道俱乐部”的数据集

import networkx as nx
import json

from bokeh.models.graphs import from_networkx
from networkx.readwrite import json_graph
import holoviews as hv
from bokeh.models import Circle, MultiLine
hv.extension('bokeh')

def read_json_file(filename):
        with open(filename) as f:
            js_graph = json.load(f)
        return json_graph.node_link_graph(js_graph)

G = read_json_file('/Users/Desktop/KCnet.json')

lst_big_nodes = []
i = 0
for lst in list(nx.connected_components(G)):
        if len(lst) > 7:  # if this connected then all nodes same color
            lst_big_nodes = lst

nd_attrs = {}
edge_attrs = {}

for nd, _ in G.nodes(data=True):
        if nd in lst_big_nodes:
            nd_attrs[nd] = '#f44171'
        else:
            nd_attrs[nd] = '#4286f4'

我在网络的边缘x需要一种以上的颜色

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