下载Java中的Pubmed Abstracts

时间:2011-03-23 18:53:42

标签: java pubmed

有没有人有一个程序的实现,可以将带有标题,作者,日期和内容的已发布的摘要下载到给定MESH术语的明文文件中?

4 个答案:

答案 0 :(得分:4)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/soap/v2.0/DOC/esoap_java_help.html有一个例子。它对我来说就像一个魅力。

我在github

上将代码发布为maven项目

答案 1 :(得分:1)

有一个内置函数可以直接在PubMed主页上下载不同类型的文件(例如XML,CSV和纯文本文件)。只需进行搜索,然后选择“发送到”,您将获得多种选择。

答案 2 :(得分:1)

作为esoap的替代方案,您还可以使用RESTful API

假设您要使用MESH keyword: galactosylceramides获取所有文章,那么您的查询将如下所示: http://www.ebi.ac.uk/europepmc/webservices/rest/search/resulttype=core&query=KW:galactosylceramides

当然,你必须解析xml结果,但我认为这不是一个大问题。

答案 3 :(得分:0)

这里有一个例子,但不是Java。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25500/