如何实现与AWS SageMaker结合使用的PyTorch数据集?

时间:2019-01-02 08:02:40

标签: python amazon-s3 pytorch amazon-sagemaker

我已经实现了一个PyTorch Dataset,该PyTorch在本地(在我自己的桌面上)工作,但是在AWS SageMaker上执行时会中断。我的Dataset实现如下。

class ImageDataset(Dataset):
    def __init__(self, path='./images', transform=None):
        self.path = path
        self.files = [join(path, f) for f in listdir(path) if isfile(join(path, f)) and f.endswith('.jpg')]
        self.transform = transform
        if transform is None:
            self.transform = transforms.Compose([
                transforms.Resize((128, 128)),
                transforms.ToTensor(),
                transforms.Normalize((0.5, 0.5, 0.5), (0.5, 0.5, 0.5))
            ])

    def __len__(self):
        return len(files)

    def __getitem__(self, idx):
        img_name = self.files[idx]

        # we may infer the label from the filename
        dash_idx = img_name.rfind('-')
        dot_idx = img_name.rfind('.')
        label = int(img_name[dash_idx + 1:dot_idx])

        image = Image.open(img_name)

        if self.transform:
            image = self.transform(image)

        return image, label

我正在遵循此example和此one too,并按如下方式运行estimator

inputs = {
 'train': 'file://images',
 'eval': 'file://images'
}
estimator = PyTorch(entry_point='pytorch-train.py',
                            role=role,
                            framework_version='1.0.0',
                            train_instance_count=1,
                            train_instance_type=instance_type)
estimator.fit(inputs)

我收到以下错误消息。

  

FileNotFoundError:[错误2]没有这样的文件或目录:'./images'

在我的示例中,他们将CFAIR数据集(在本地下载)上载到S3。

inputs = sagemaker_session.upload_data(path='data', bucket=bucket, key_prefix='data/cifar10')

如果我窥视inputs,那只是一个字符串文字s3://sagemaker-us-east-3-184838577132/data/cifar10。创建DatasetDataLoader的代码显示为here,除非我跟踪源代码并逐步执行逻辑,否则这无济于事。

我认为ImageDataset内部需要发生的事情是提供S3路径并使用AWS CLI或其他查询文件并获取其内容的方法。我认为AWS CLI是不正确的方法,因为这依赖于控制台,我将必须执行一些子流程命令,然后进行解析。

必须有配方或东西来创建由Dataset文件支持的自定义S3,对吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我能够使用Dataset创建一个由S3数据支持的PyTorch boto3。如果有人感兴趣,这是代码段。

class ImageDataset(Dataset):
    def __init__(self, path='./images', transform=None):
        self.path = path
        self.s3 = boto3.resource('s3')
        self.bucket = self.s3.Bucket(path)
        self.files = [obj.key for obj in self.bucket.objects.all()]
        self.transform = transform
        if transform is None:
            self.transform = transforms.Compose([
                transforms.Resize((128, 128)),
                transforms.ToTensor(),
                transforms.Normalize((0.5, 0.5, 0.5), (0.5, 0.5, 0.5))
            ])

    def __len__(self):
        return len(files)

    def __getitem__(self, idx):
        img_name = self.files[idx]

        # we may infer the label from the filename
        dash_idx = img_name.rfind('-')
        dot_idx = img_name.rfind('.')
        label = int(img_name[dash_idx + 1:dot_idx])

        # we need to download the file from S3 to a temporary file locally
        # we need to create the local file name
        obj = self.bucket.Object(img_name)
        tmp = tempfile.NamedTemporaryFile()
        tmp_name = '{}.jpg'.format(tmp.name)

        # now we can actually download from S3 to a local place
        with open(tmp_name, 'wb') as f:
            obj.download_fileobj(f)
            f.flush()
            f.close()
            image = Image.open(tmp_name)

        if self.transform:
            image = self.transform(image)

        return image, label

答案 1 :(得分:0)

在SageMaker远程实例上进行训练时,SageMaker服务将启动一个新的EC2实例,并将训练/测试通道复制到EC2实例本地磁盘上的文件夹中,并在其中启动训练脚本。

因此,您可以使用os.environ['SM_CHANNEL_TRAIN']来查找训练/测试/验证通道的位置。
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