在Numpy中获得向量集合的并集的有效方法

时间:2018-12-27 19:21:03

标签: python arrays numpy

我正在尝试实现特定的二进制搜索算法。 “结果”一开始应为空集,并且在搜索过程中,结果变量将成为与我们获得的新结果的并集。

基本上:

results = set()
for result in search():
  results = results.union(result)

但是这样的代码实际上不适用于Numpy数组,因此我们为此目的使用np.union1d

results = np.array([])
for result in search():
    result = np.union1d(results, result)

上面的代码也不起作用,因为例如,如果我们有两个向量a = [1,2,3]b=[3,4,5],则np.union1d(a, b)将返回:

[1, 2, 3, 4, 5]

但是我希望它返回:

[[1, 2, 3], [3,4,5]]

由于没有重复的向量,因此,例如,如果我们有union([[1, 2, 3], [3,4,5]], [1,2,3]),则返回值将保持不变:

[[1, 2, 3], [3,4,5]]


所以我想说我需要一个基于 numpy数组的联合

我还考虑过使用np.append(a, b),然后使用np.unique(x),但是这两个函数都将低维数组投影到高维数组。 np.append还具有axis=0属性,该属性保留所有插入的数组的维数,但是如果没有维数错误,我将无法高效地实现它。

问题:

如何有效地实现基于向量的集合?这样,并集中的点将被视为向量而不是标量,并将保留其向量形式和维数。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这是一些基本的设置操作。

定义一对列表(它们可以是np.array([1,2,3]),但这不是您显示的内容。

In [261]: a = [1,2,3]; b=[3,4,5]

其中一些的列表:

In [263]: alist = [a, b, a]
In [264]: alist
Out[264]: [[1, 2, 3], [3, 4, 5], [1, 2, 3]]

我可以通过转换为元组并将其放入set中来获得唯一值。

In [265]: set([tuple(i) for i in alist])
Out[265]: {(1, 2, 3), (3, 4, 5)}

我还可以将该列表转换为二维数组:

In [266]: arr = np.array(alist)
In [267]: arr
Out[267]: 
array([[1, 2, 3],
       [3, 4, 5],
       [1, 2, 3]])

并使用unique和轴参数获取唯一行:

In [269]: np.unique(arr, axis=0)
Out[269]: 
array([[1, 2, 3],
       [3, 4, 5]])

比较时间

In [270]: timeit np.unique(arr, axis=0)
46.5 µs ± 142 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)
In [271]: timeit set([tuple(i) for i in alist])
1.01 µs ± 1.7 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000000 loops each)

将数组转换为列表或将列表转换为数组会花费一些时间,但是基本模式仍然存在。

In [272]: timeit set([tuple(i) for i in arr.tolist()])
1.53 µs ± 13.2 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000000 loops each)
In [273]: timeit np.unique(alist, axis=0)
53.3 µs ± 90.3 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)

对于较大的,现实的资源,相对时间可能会有所变化,但是我希望元组的集合将保持最佳状态。设置操作不是numpy的强项。 unique进行排序,然后消除重复项。 set使用散列方法,类似于Python用于字典的方法。

如果必须迭代地从source收集值,我建议您建立一个列表,并进行一次set/unique

alist = []
for x in source():
    alist.append(x)

或以下之一:

alist = [x for x in source()]
alist = list(source())
alist = [tuple(x) for x in source()]
alist = [tuple(x.tolist()) for x in source()]