尝试在R

Question

我正在尝试按时间顺序进行聚类（时间受限聚类），所以我使用R中的const.clust包。我必须构造一个连接矩阵，因此我要使用contiguity.mat函数。它从点之间的连接文件中读取的数据构造一个连续矩阵。就我而言，这些点是采样日期，不是等距的。我不确定contiguity.mat是否正确，因为在所有示例中，我发现这些点都是坐标（用于约束空间聚类），而不是日期。

考虑到这一点，当我运行contiguitiy.mat时，R会回答我一个错误。

library(mvpart)
library(const.clust)

from<-abun0[1:50,1]
from<-as.Date(from)
from<-data.frame(from)
to<- abun0[2:51,1]
to<- as.Date(to)
to<-data.frame(to)
from.to<-cbind(from,to)
links.mat.spp <- contiguity.mat(from.to, 51)

contiguity.mat（from.to，51）中的错误：错误：'From'> n

其他选项：

from<-abun0[1:50,1]
from<-as.Date(from)
from<-data.frame(from)
to<- abun0[2:51,1]
to<- as.Date(to)
to<-data.frame(to)
from.to<-cbind(from,to
from.to<-as.matrix(from.to)
links.mat.spp <- contiguity.mat(from.to, 51)

[<-（*tmp*，j，i，value = 1）中的错误：   数组没有'dimnames'属性

我不明白我现在要做什么。拜托，有人可以帮我吗？

Answer 1

我不知道const.clust软件包或contiguity.mat，但是您确定需要51作为第二个参数吗？因为from.to矩阵现在只构成了50行。