brms-如何处理缺少的对比度(忽略一个级别)

时间:2018-12-18 13:39:44

标签: r missing-data bayesian stan

我正在尝试使用brms软件包来研究3种情况之间四种蝴蝶物种的寄生虫发生率变化。除一种外,所有其他物种均已在每种条件下进行了测试,因此出现了我的问题。物种4未在条件3下进行测试。

我的完整模型是: mod15=brm(#ind_parasitized|trials(#ind_parasitized+#ind_nonparasitized)~0+condition*butterfly_species,data=dat3,iter=5000,warmup=2000,core=4,family=binomial)

此模型返回未能收敛的错误。但是,从模型摘要来看,Rhat,Eff。样本,并且链的混合是好的,但是很明显,因为区域3中缺少构造类4,模型无法忽略/排除。

四处阅读,我已经看到了如何处理缺失的值,但是我不知道该如何处理缺失的约束。我以为可以使用brm_multiple来解决这个问题,但是这种方法不起作用,因为在这种情况下,我尝试测试不再存在的constrast。

任何建议将不胜感激!

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