如何在R / plotROC中重新调整ROC曲线？

Question

我刚刚开始学习roc曲线。我正在尝试制作一个ROC plot，但似乎该曲线的弯曲方向比平常要错误-请参见附件

您能帮助扭转曲线，使其沿“通常”方向弯曲吗？

我的数据是

p <- structure(list(t = c(29354L, 7445L, 22309L, 29699L, 29711L, 14765L, 22257L, 
29715L, 29772L, 13320L, 20905L, 12950L, 3400L, 14800L,7400L, 21890L, 19400L, 14800L, 14700L, 22200L, 1688L, 4500L, 8438L, 13500L, 14800L, 
12580L, 12950L, 13320L, 11840L, 13320L, 14800L, 13690L, 11250L, 12210L, 13320L, 13320L, 14800L, 12580L,20720L, 11840L, 14800L, 7030L, 14800L, 
14800L, 8325L, 11100L,10730L, 13690L, 12210L, 14800L), a = c(0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 
1L,0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L,1L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L,0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L)), .Names = c("t","a"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 50L))

我使用了以下内容

library(plotROC)
basicplot <- ggplot(p, aes(d = p$a, m = p$t)) + geom_roc() + theme_bw()
basicplot + style_roc() 

奖励问题

我用Youden来确定最佳截止点，即13410。有什么想法可以特别注意这一点-例如通过突出显示一个红点？

Answer 1

您可以做两件事，交换1和0的名称，或使用geom_roc(increasing = FALSE)。请参见PlotROC vignette。这是假设您的模型实际上是以这种方式执行的，并且并没有真正地具有低灵敏度和高假阳性率，而只是将其反转。

basicplot <- ggplot(p, aes(d = a, m = t)) + geom_roc(increasing = FALSE) + theme_bw()
basicplot + style_roc()