Question

是否可以在R会话中重新加载具有本机扩展名的R包？我正在开发Rliblinear，它使用了几个C函数。如果我对包中的R代码进行了更改，我可以重新安装并重新加载;

$ R CMD build Rliblinear
$ R CMD INSTALL Rliblinear

然后在R shell中;

> detach("package:Rliblinear", unload=TRUE)
> library(Rliblinear)

但是，除非我重新启动C解释器，否则R函数不会受到影响。有没有办法可以强制解释器重新加载共享对象Rliblinear.so？

Answer 1

这将列出您加载的动态链接库：

library.dynam()

这将在Rliblinear包中卸载Rliblinear.*。

library(Rliblinear)

# ... run package ...

detach("package:Rliblinear", unload = TRUE)
library.dynam.unload("Rliblinear", system.file(package = "Rliblinear"))

您可以再次发出library.dynam()，以检查其不再列出。

Answer 2

我倾向于使用littler在命令行上进行测试，以确保我获得了新的R会话。您也可以使用Rscript执行此操作。

所以我的工作流程将是

$ R CMD INSTALL Rliblinear/    ## alternatively, install from tarball
$ r -lRliblinear -e'someExpressionFromThePackage()'

你也可以用&&包裹在一行中和/或在干净的步骤之前。

Answer 3

这是G.Grothendieck先生答案的扩展，如果嵌入“yourpackage”，可以从R控制台一次重新编译它：

reload <- function( path ){

   detach("package:yourpackage", unload = TRUE)
   library.dynam.unload("yourpackage", system.file(package = "yourpackage"))

   path <- paste( "--vanilla  CMD INSTALL ", path )

   system2( 'R', path  )
   require("yourpackage")
}

然后从R：

yourpackage :: reload（'/ home / me / yourpackage'）

使用已编译的扩展重新加载R包

3 个答案: