如何在MPI代码上从gprof获得有意义的结果？

Question

我正在优化MPI代码，并且正在使用Gprof。 问题是我获得的结果是完全不合理的。我的工作流程如下：

• 编译添加-pg作为编译标志的代码。

• 运行代码mpirun -np Nproc EXEC.exe arg1 ... argN。

• 在可执行文件gprof EXEC.exe

上运行gprof

这有什么问题？

Answer 1

运行gprof的指令通常假定程序是串行或单进程但多线程的。

要通过MPI程序等多进程程序运行gprof，您将需要

1. 确保每个进程输出自己的文件
2. 明确地汇总跨进程的文件
3. 对结果运行gprof。

This blog post或these instructions at LLNL是很好的起点：

1. 设置记录不充分的GMON_OUT_PREFIX环境变量，例如在bash中，export GMON_OUT_PREFIX=gmon.out-在运行mpiexec命令之前（然后，根据环境，您可能必须运行mpirun -x GMON_OUT_PREFIX -np Nproc EXEC.exe arg1 ... argN以确保每个进程都具有环境变量）
2. 使用gprof本身来收集和汇总结果gprof -s EXEC.exe gmon.out-*
3. gprof EXEC.exe gmon.sum（或仅使用gprof EXEC.exe gmon.out-12345或gprof EXEC.exe gmon.out-*检查单个文件或一起检查文件）