Question

我有两个文件，希望将它们协调成一个用于绘制xy图的文件。

File1每行包含一个不同的x值，然后在同一行上包含一系列y值。 File2包含每个点x我从File1需要的特定y值。

实际上，我有50,000行和50-100列，但这是一个简化的示例。

File1如下所示：

 1 15 2 3 1
 2 18 4 6 5
 3 19 7 8 9
 4 23 10 2 11
 5 25 18 17 16

第1列是行号。
第2列是我的x值，以升序排序。
第3-5列是我的y值。它们不是唯一的。一行上的y可以匹配另一行上的y。

File2如下所示：

File2中每一行的y对应于与同一行中File1的y之一匹配的数字（对于前几百行）。前几百行之后，它们可能并不总是匹配。因此，File2的行少于File1的行。我想忽略这些行或将其填充为0。

目标

输出File3应该包含：

或带有

的行

 19 0

已删除，以适用于该脚本的为准。如果这两种选择都不可行，那么我也可以逐行匹配y值，直到没有匹配项，然后再停止。

尝试

我最初将File2路由到一个数组中：

  a=( $(grep -e '14,12|:*' File0 | cut -b 9-17) )

但是随后我注意到Stackexchange上的类似问题（1，2）使用了第二个文件，因此我将上述grep命令路由到了File2中。

这些问题稍有不同，因为我需要File1中的特定列，但是我认为我至少可以将它们用作起点。这些问题的解决方案：

1）

        grep -Fwf File2 File1

当然会复制File1的整个行，我不确定如何从那里继续。或

2）

  awk 'FNR==NR {arr[$1];next} $1 in arr' File2 File1

对我来说完全失败，除了一般的awk帮助响应外，没有错误消息。

这有可能吗？谢谢。

Answer 1

awk 'NR==FNR { arr[NR] = $1; next } {
    for (i = 3; i <= NF; ++i) {
        if ($i == arr[n]) {
            print $2, $i
            n++
            next
        }
    }
    print $2, 0
}' n=1 file2 file1

Answer 2

另一个awk，将仅打印第一个匹配项

$ awk 'NR==FNR {a[$1]; next} 
               {f2=$2; $1=$2=""; 
                for(k in a) if($0 FS ~ FS k FS) {print f2,k; next}}' file2 file1

15 2
18 5
23 2
25 18

填充FS以消除子字符串匹配。请注意文件的顺序，应首先提供file2。

通过行号交叉引用两个文件中的字符串，并将它们收集到第三个文件中

目标

尝试

2 个答案: