Question

我是一名癌症研究人员，我们想知道你们中的任何人是否知道如何制作一个调用其他脏话的SLURM脚本。如果上一个脚本成功完成，请继续下一个调用。即：

    #include <stdio.h>

    int main(void)
    {
        int i = 68;
        char ch = i;
        printf("%c\n", ch);
        return 0;
    }

Answer 1

您可以使用--dependency的{{1}}选项提交5个作业。

来自manpage：

-d，--dependency =推迟此作业的开始，直到满足指定的依赖关系为止。

在您的情况下，它会像这样：

sbatch

请注意，在这种情况下，如果从属作业失败，则依赖于其他作业的作业将无限期保持待处理状态。对于作业因A=$(sbatch --parsable a.slurm) B=$(sbatch --parsable --dependency=afterok:$A a.slurm) C=$(sbatch --parsable --dependency=afterok:$B a.slurm) D=$(sbatch --parsable --dependency=afterok:$B a.slurm) E=$(sbatch --parsable --dependency=afterok:$D a.slurm)而失败的情况，您将不得不手动清理它们或提交空作业。

如果您的工作流程变得更加复杂，那么调查workflow managers或Bosco之类的Fireworks的使用可能会很有趣。

主SLURM脚本，调用其他SLURMS

1 个答案: