如何在dartR中绘制Ho v Hs?

时间:2018-12-06 11:26:52

标签: r

我有Dartseq的SNP数据集(148个个体和12,123个基因座)。
我正在dartR中对其进行分析。
我已经在dartR中计算了Ho(gl.Ho(gl))和Hs(gl.Hs(gl))。
我想绘制Ho v Hs。
我该怎么办?
我认为这应该很容易,但是我没有取得任何进展。
我知道以下内容:

head(Ho)

39086092-43-A/T 39030115-36-G/T 39036131-46-C/T 39031387-28-T/A  39043148-8-C/T 
0.006944444     0.000000000     0.014184397     0.076388889     0.007246377 
 39052543-5-C/T 
0.000000000 

str(Ho) # # Shows the structure of the data

Named num [1:12119] 0.00694 0 0.01418 0.07639 0.00725 ...
 - attr(*, "names")= chr [1:12119] "39086092-43-A/T" "39030115-36-G/T" "39036131-46-C/T" "39031387-28-T/A" ...

class(Ho) # numeric

[1]“数字”

head(Hs)

39086092-43-A/T 39030115-36-G/T 39036131-46-C/T 39031387-28-T/A  39043148-8-C/T 
0.006920332     0.013888210     0.014083799     0.192105517     0.049438143 
 39052543-5-C/T 
0.027391975

PS。在我找到有关Markdown帮助的帖子后,今天上午进行了编辑。现在至少更容易阅读。

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