我有一个包含多个不同分析的数据框,每个分析都包含多行数据。我只想从每个分析中计算出几行的平均值,并且这些行在各分析之间是不同的。有一个包含分析的数据框,另一个包含每个分析的平均值所需的开始和结束行号。下面是一个简单的示例。
分析
df1 <- structure(list(analysis = c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L),
line = c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 8L, 1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 8L, 1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 8L),
value = c(4.8, 9.8, 7.1, 7.4, 7.4, 3.3, 4.5, 8.7, 3.9, 3.6, 1.9, 9.4, 0.9, 0.6, 2.1, 6.1, 5.3, 4.7, 9.7, 8.6, 8.9, 3.4, 8.7, 7.1)),
class = "data.frame", row.names = c(NA, -24L))
我希望每个分析的均值的起止行号:
df2 <- structure(list(analysis = 1:3,
startnum = c(3L, 3L, 2L),
endnum = c(7L, 6L, 4L)),
class = "data.frame", row.names = c(NA, -3L))
我认为结果数据框将是这样的:
structure(list(analysis=1:3,
avgval=c(5.94, 3.2, 7.67)),
class = "data.frame", row.names = c(NA, -3L))
我认为,“申请”家庭的答案很简单,但无法考虑如何做到这一点。我可以将数据框转换为“ lapply”的列表,但不知道如何继续操作。
非常感谢, -R
答案 0 :(得分:1)
这是使用data.table
library(data.table)
setDT(df1)
setDT(df2)
在line
中创建一个df2
列,按组从startnum
到endnum
的顺序进行。
df2 <- df2[, .(line = seq(startnum, endnum)), by = analysis]
加入两个data.tables并按组进行聚合。
out <- df1[df2, on = c("analysis", "line")]
out <- out[, .(avgval = mean(value)), by = analysis]
out
# analysis avgval
#1: 1 5.940000
#2: 2 3.200000
#3: 3 7.666667
如果您想继续进行data.frame
,请致电setDF(out)
。
希望这会有所帮助。
答案 1 :(得分:0)
在tidyverse
中,您可以执行以下操作:
df1 %>%
left_join(df2, by = c("analysis" = "analysis")) %>% #Merging df1 with df2
group_by(analysis) %>% #Grouping by "analysis"
summarise(avgval = mean(value[line >= startnum & line <= endnum])) #Calculating the mean based on given conditions
analysis avgval
<int> <dbl>
1 1 5.94
2 2 3.20
3 3 7.67