两个Linux群集的R库路径

Question

我正在使用两个共享相同文件系统的Linux群集。 因此，当我在一个集群中安装库时，它们 安装在两个群集共享的同一文件夹（/ home / R）中， 如果稍后我在另一个群集上工作，则会导致冲突。

您是否知道是否有任何外部变量甚至R隐藏配置 我可以使用，以便在一个群集上启动R（或Rstudio）后， 检测集群以及库位置的相应路径 （例如/ home / R / cluster1和/ home / R / cluster2）？

谢谢。

Answer 1

是的，应该很简单。创建一个Rprofile.site文件（有关详细信息，请参见Initialization at Startup文档）。在该文件中，您可以编写R代码来检测您所在的集群。

一旦知道了所在的群集，请使用.libPaths()函数（请参阅libPaths docs）来更改库路径。

R每次启动新会话时都会运行Rprofile.site文件，因此每个会话应针对其所在的群集对其库路径进行适当调整。