使用MySQL数据库在R中生成热图时出错

时间:2018-12-03 11:40:24

标签: mysql r heatmap

我正在尝试使用MySQL上的表中的数据创建热图。 当我运行以下代码时,我收到此错误消息:

  

没有适用于“ op_vars”的适用于“ NULL”类对象的方法

这是我正在使用的代码:

localuserpassword <- "CrowdVision2018"
tsadev <- dbConnect(RMariaDB::MariaDB(),user="tsadev", 
password=localuserpassword, dbname='tsadev',host='tsadev.ci71sbjd5rvy.eu- 
west-1.rds.amazonaws.com')

table <- tbl(tsadev, sql("SELECT 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12 FROM heatmap "))

##### HEATMAP


my_palette <- colorRampPalette(c("black","grey"))

heatmap.2(data.matrix(table), dendrogram='none', Rowv=TRUE, Colv=TRUE, 
main="", trace="none", col=my_palette, labRow = TRUE, labCol = FALSE, 
key=FALSE, symkey=FALSE)

有人知道如何解决此问题吗?

This is a picture of the mock up data I am using

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