Question

我有一个索引列表，我不知道它们在向量中的对应条目，因为向量分布在各个等级之间。我必须将这些索引发送到负责的行列以获取数据。

另一方面，“我的”排名也从未知数量的排名中获取索引列表。收到列表后，“我的”等级必须将相应的数据发送到该请求等级。

我认为我必须使用MPI_Probe和MPI_Gather的混合物。但是目前，我还看不到如何接收数量未知的列表。

我认为它看起来必须像这样，但是我如何才能从更大的未知数量的排名中接收数据呢？还是我必须遍历所有可能的职位，才能给我带来一些好处？

 MPI_Status status;
 int nbytes; 
 std::vector<Size> indices;
 MPI_Probe(MPI_ANY_SOURCE,MPI_ANY_TAG, comm, &status);
 MPI_Get_count(&status,MPI_UINT64_T, &nbytes);

 if(nbytes!=MPI_UNDEFINED){
     indices.reserve(nbytes);
     MPI_Recv(&indices[0],nbytes,MPI_UINT64_T,status.SOURCE,status.TAG,comm,&status);
 }

Answer 1

这与几年前我为parallel I/O做的事情很相似。

一个选项：

从所有发件人中，获取您需要发送给彼此的邮件大小
发送尺寸（如果所有职级都是发件人，则聚集，否则发送/接收）
执行一个（所有）gatherv，它将检索每个接收器上的大小

您可以使用无阻塞发送/接收以及collectv（MPI3），并且可以很好地扩展（取决于硬件）至8个发送者的500个内核。

我们这样做的方法是逐个遍历几个MB的向量，然后分块发送数据。当然，块越大，越好，但每个发件人行所需的存储容量也越多。

MPI从未知数量的等级接收数据

1 个答案: