计算Gamma GLM模型的工作残差

时间:2018-11-29 22:34:57

标签: r model glm lm gamma-distribution

我正在尝试计算Gamma GLM模型的工作残差。我要手动执行此操作,因为我想逐步计算部分残差。我的模型及其系数和预测描述如下:

library(datasets)
data(mtcars)

model <- glm(mpg ~ cyl + disp + hp, data=mtcars, family=Gamma)
coefs <- coef(model)
pred <- coefs[1] + coefs[2]*mtcars$cyl + coefs[3]*mtcars$disp + coefs[4]*mtcars$hp

我试图通过应用公式(value-fit.value)/fitted.value来计算工作残差,该公式对于Poisson glm很好。但是,它对Gamma无效,因为这些值与我使用函数resid()生成的值不同:

(mtcars$mpg - (-pred^(-1)))/-pred^(-1))
resid(model, type="working")

有人知道如何估算这些工作残差然后计算部分残差吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

工作残差仅为model$residuals。参见?glm


## setup
library(datasets)
data(mtcars)
model <- glm(mpg ~ cyl + disp + hp, data = mtcars, family = Gamma)

## family info
oo <- Gamma(link = "inverse")

## compute linear predictor manually (assuming no model offset)
coefs <- coef(model)
eta <- coefs[1] + coefs[2] * mtcars$cyl + coefs[3] * mtcars$disp +
       coefs[4] * mtcars$hp

## compute working residuals
resi_working <- (mtcars$mpg - oo$linkinv(eta)) / oo$mu.eta(eta)

## validation
range(resi_working - model$residuals)
#[1] 0 0