Question

我有一个基于所有真菌丰度的混沌距离矩阵：

      CR10      CR11      CR13      CR14      CR17      CR18      CR19
CR11 0.4531840                                                            
CR13 0.4288178 0.4624915                                                  
CR14 0.5903908 0.5466617 0.4942469                                        
CR17 0.4784990 0.3387325 0.6136265 0.5779121                              
CR18 0.7649840 0.7537409 0.7526077 0.5632825 0.4153391                    
CR19 0.3772907 0.4579895 0.3208187 0.3706775 0.5644193 0.7380274          
CR20 0.4598706 0.5529427 0.6424340 0.6690386 0.3855154 0.5509150 0.6406800

和具有相同环境图的33个环境变量的表。

我跑步时：

fungAbundAdonis <- lapply(colnames(env2), function(x) {
  form <- as.formula(paste("OTU.table2", x, sep="~")) 
  z <- adonis(form, data = env2, permutations=999)
  return(data.frame(env = rownames(z$aov.tab), Rsq = z$aov.tab$R2,P = z$aov.tab$P))}
)

我收到此错误：

adonis错误（form，data = env2，排列= 999）：公式的右侧没有可用的术语。

我不明白为什么，因为当我将相同的脚本与图的距离矩阵从1到9以及12 15和16以及这些图的环境表一起使用时，它工作正常。有人知道错误的根源是什么吗？谢谢！

Answer 1

您的问题没有可重复的例子，我不得不猜测。但是，如果变量在右侧是 constant ，我可以重现您的错误消息。当您子集env2且在该选定子集中一个变量只有一个值时可能会发生这种情况。（这仅涉及vegan 2.5-x或发行版本：vegan 2.6-0不会显示错误消息。）

adonis：公式右侧的错误没有可用的术语

1 个答案: