有效地迭代pandas.DataFrame,同时一次访问多个索引行

时间:2018-11-26 15:11:14

标签: python pandas performance loops dataframe

我已经阅读了有关如何迭代pandas.DataFrame高效(https://engineering.upside.com/a-beginners-guide-to-optimizing-pandas-code-for-speed-c09ef2c6a4d6)的答案和博客条目,但是我还有一个问题。

当前,我的DataFrame表示一个GPS轨迹,其中包含列时间,经度和纬度。 现在,我想计算一个称为到下一个距离的特征。因此,我不仅要遍历行并在单行上执行操作,还必须在一次迭代中访问后续行。

i=0
for index, row in df.iterrows():
    if i < len(df)-1:
        distance = calculate_distance([row['latitude'],row['longitude']],[df.loc[i+1,'latitude'],df.loc[i+1,'longitude']])
        row['distance'] = distance

除了这个问题,在计算速度,应用平滑或其他类似方法时,我也遇到相同的问题。

另一个例子: 我想搜索速度== 0 m / s的数据点并从这些点传出,我想将所有后续数据点添加到数组中,直到速度达到10 m / s(以寻找从0m / s加速到10m / s。

您对如何编写像possbile这样高效的东西有什么建议吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您可以使用pd.DataFrame.shift将移位后的序列添加到数据框中,然后通过apply:馈入函数

def calculate_distance(row):
    # your function goes here, trivial function used for demonstration
    return sum(row[i] for i in df.columns)

df[['next_latitude', 'next_longitude']] = df[['latitude', 'longitude']].shift(-1)
df.loc[df.index[:-1], 'distance'] = df.iloc[:-1].apply(calculate_distance, axis=1)

print(df)

   latitude  longitude  next_latitude  next_longitude  distance
0         1          5            2.0             6.0      14.0
1         2          6            3.0             7.0      18.0
2         3          7            4.0             8.0      22.0
3         4          8            NaN             NaN       NaN

这适用于任意函数calculate_distance,但是您的算法很可能是矢量化的,在这种情况下,您应该使用按列的Pandas / NumPy方法。