Question

我正在编写一个小脚本，在其中我要将变量的值设置为等于命令的输出。但是，有问题的命令是对带有命令行参数的另一个脚本的调用。在这种情况下，我像往常一样使用反引号，但是问题是计算机出现错误，试图将命令行参数解释为命令。

#!/bin/bash

filename="$1"

while read p; do
        echo "This is the gene we are looking at: ""$p"
        lookIn= `./findGeneIn "$p" burgdorferi afzelii garinii hermsii miyamotoi parkeri`
        echo "$lookIn"
        #grep "$p" "$lookIn""/""prokka_""$lookIn""/*.tsv" | awk '{print $1}' 
done < $filename

我正在尝试将变量lookIn设置为等于./findGeneIn "$p" burgdorferi afzelii garinii hermsii miyamotoi parkeri的输出，其中./findGeneIn是一个脚本，而burgdorferi，...，parkeri是命令行参数为./findGeneIn。

问题是，我收到一条错误消息：“ burgdorferi：找不到命令”。因此，它试图将这些参数解释为命令。我如何才能做到这一点呢？

Answer 1

lookIn= `./findGeneIn "$p" burgdorferi afzelii garinii hermsii miyamotoi parkeri`
       ^

删除多余的空间。分配的等号周围不能有空格。

在此处有空格的情况下，Bash将行解析为var=value command，它将运行一个命令，其中$var临时设置为"value"。或者，在这种情况下，它会将反引号的结果解释为命令名称，并将lookIn=解释为空变量分配。

将变量设置为等于包含非命令字的命令输出

1 个答案: