我正在尝试使用twiny()
中的matplotlib
来绘制带有两个x轴的曲线,这些曲线来自包含以下数据块的XML文件:
<data>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:27:06.500003</utc>
<ra_j2000>23.9722686269</ra_j2000>
<dec_j2000>-1.23845121893</dec_j2000>
<mag>9.96074403533</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:27:54.500002</utc>
<ra_j2000>23.9930913364</ra_j2000>
<dec_j2000>-1.03788334773</dec_j2000>
<mag>11.356437889</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:38:36.500002</utc>
<ra_j2000>0.267638646848</ra_j2000>
<dec_j2000>1.56055091433</dec_j2000>
<mag>11.1642458641</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:46:18.500000</utc>
<ra_j2000>0.462353662364</ra_j2000>
<dec_j2000>3.34334963425</dec_j2000>
<mag>11.1082534741</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:57:18.500001</utc>
<ra_j2000>0.740393528722</ra_j2000>
<dec_j2000>5.78641590694</dec_j2000>
<mag>11.0688955214</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T23:03:06.499995</utc>
<ra_j2000>0.888541738338</ra_j2000>
<dec_j2000>7.03265231497</dec_j2000>
<mag>10.2358937709</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T23:05:42.500002</utc>
<ra_j2000>0.955591973177</ra_j2000>
<dec_j2000>7.5832430461</dec_j2000>
<mag>10.86206725</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T23:06:48.499999</utc>
<ra_j2000>0.984093767077</ra_j2000>
<dec_j2000>7.81466175077</dec_j2000>
<mag>10.3466108708</mag>
</meas>
</data>
我的问题是我在这些X轴上获得了未对齐的值。这是我的Python脚本:
import math
import xml.etree.ElementTree as ET
from astropy.time import Time
from astropy.coordinates import get_sun
from datetime import datetime, timedelta
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.ticker as ticker
from matplotlib import dates
tree = ET.parse('20181110_10241.xml')
root = tree.getroot()
x_ut = []
x_phi = []
y_brightness = []
def convert_time(obs_time):
obs_time = str(obs_time)
d, t = obs_time.split('T')
year, month, day = map(int, d.split('-'))
hour, minute, second = t.split(':')
return datetime(year, month, day, int(hour), int(minute)) + \
timedelta(seconds=float(second))
def get_sun_coords(obs_time):
sun_coords = get_sun(obs_time)
sun_ra = sun_coords.ra.degree
sun_dec = sun_coords.dec.degree
return sun_ra, sun_dec
def get_phase_angle(sun_ra, sun_dec, target_ra, target_dec):
phase_angle = math.degrees(math.acos(-math.sin(math.radians(sun_dec))*math.sin(math.radians(target_dec)) - math.cos(math.radians(sun_dec))*math.cos(math.radians(target_dec))*math.cos(math.radians(sun_ra-target_ra))))
return phase_angle
for meas in root.findall('meas'):
obs_time = Time(meas.find('utc').text, format='isot', scale='utc')
target_ra = float(meas.find('ra_j2000').text)*15
target_dec = float(meas.find('dec_j2000').text)
mag = float(meas.find('mag').text)
sun_ra, sun_dec = get_sun_coords(obs_time)
phase_angle = get_phase_angle(sun_ra, sun_dec, target_ra, target_dec)
obs_time = convert_time(obs_time)
x_ut.append(obs_time)
x_phi.append(phase_angle)
y_brightness.append(mag)
fig, ax1 = plt.subplots()
ax1.plot(x_ut, y_brightness, marker='o', label='apparent brightness')
ax1.set_xlim(x_ut[0],x_ut[-1])
ax1.xaxis.set_major_locator(dates.MinuteLocator(interval=1))
ax1.xaxis.set_major_formatter(dates.DateFormatter('%H:%M'))
ax1.tick_params(axis='x', rotation=45)
ax1.minorticks_on()
ax1.legend()
ax1.grid()
ax1.set_xlabel('time [h:m, UT]')
ax1.set_ylabel('apparent brightness [mag, CR]')
ax2 = ax1.twiny()
ax2.plot(x_phi,y_brightness, marker='^', color='red')
ax2.set_xlim(x_phi[0],x_phi[-1])
ax2.xaxis.set_major_locator(ticker.MultipleLocator(1))
ax2.minorticks_on()
ax2.set_xlabel('phase angle (phi) [deg]')
plt.gca().invert_yaxis()
plt.tight_layout(pad=0)
plt.show()
会产生以下情节:
我打算稍后(通过使用visibility=False
隐藏红色曲线,在这里绘制它只是为了查看x轴值的正确对齐,即实际上两条曲线必须重叠! ,因为相位角(x_phi
)的值取决于相应的时间戳(x_ut
)的值,但是正如您可以清楚地看到的那样,只有起点和终点正确对齐,但是大多数中间的数据未对齐(相位曲线向右移动)。
我在做什么错了?
最初,我认为相位角(x_phi
)随时间呈非线性变化,因此两条曲线的set_xlim()
都以不同的方式拉伸它们,但这是不正确的,我已经绘制了x_phi
与x_ut
相对,并且存在明显的线性变化:
谢谢您的帮助!
编辑:tel在下面的回答中证明了非线性。因此,我稍微改变了我的问题。
如果我从两个子图set_xlim()
和ax1
中都删除了ax2
,则:
1)尽管给出值的列表x_phi
从最大值开始,但x轴的上端自动从最小值开始自动反转-如何在不使用{的情况下避免这种反转{1}}? (在不同情况下,我在invert_axis()
列表中总是只增加或减少值)
2)总共有3个列表:x_phi
,x_ut
和x_phi
;而且我实际上只需要绘制y_brightness
对y_brightness
的曲线,并另外将x_ut
的值(带有x_phi
)与相应的时刻的时间值对齐ticker.MultipleLocator(1)
-我该怎么做?
我的问题与此类似: How do I align gridlines for two y-axis scales using Matplotlib? 但是在我的情况下,x轴上方的刻度线之间没有线性间隔,因此我无法使用该解决方案。
此外,此问题涉及类似的问题:
trouble aligning ticks for matplotlib twinx axes
但是在我的情况下,我不知道如何表达两个X轴之间的关系,因为数据类型非常不同:日期时间与浮点数。它们之间的唯一关系是一对一的,即x_ut
中的第一个值与x_ut
中的第一个值,第二个至第二个相关,依此类推;而且这种关系是非线性的。
编辑2:现在,我之前的EDIT中的数字1)已解决。对于其余的问题,看来我必须使用x_phi
才能相对于主要x轴重新缩放辅助x轴。为此,我还必须定义register_scale()
的子类。到目前为止,我仅发现了两个复杂的示例(对于我而言):
https://matplotlib.org/examples/api/custom_scale_example.html
https://stackoverrun.com/es/q/8578801(西班牙语,但代码中带有英语注释)
我不确定我是否能够自己执行此操作,因此我仍在寻求任何帮助。
答案 0 :(得分:0)
您的绘图例程看起来正确。相反,问题似乎在于,时间和相位角之间的线性度存在 偏差(非常小)。您可以通过在时间与角度图上覆盖一条黑色直线来看到它(单击下面以在单独的窗口中打开并放大以清楚地看到它):
以下是突出显示偏差的缩放:
使两个x轴对齐的唯一方法是:
这两个都是Bad Bad Idea™️,并且您都不应该这样做。您需要按原样绘制数据,而不是试图用聪明的技巧掩盖任何不一致之处。少了就是学术上的不诚实。
您唯一的选择是弄清楚为什么时间和角度不符合您的期望。这可能是您的代码中的问题,也可能是您在get_phase_angle
中使用的公式中的问题。或者这可能是您的基础数据集中的一个问题,例如,度数测量中是否存在噪声。或者,实际上,时间和角度没有线性关系。毕竟,地球并不完美。
答案 1 :(得分:0)
是的!我已经成功获得了想要的结果,而没有定义新的比例尺类!以下是已在脚本中从问题中添加/修改的相关代码部分(稍后将从用户命令行输入中读取变量step
,或者我可能会找到另一种自动滴答频率设置的方法):
x_ut = []
x_phi = []
x_phi_ticks = []
x_phi_ticklabels = []
y_brightness = []
# populate lists for the phase angle ticks and labels
i = 0
step = 15
while i <= (len(x_ut)-step):
x_phi_ticks.append(x_ut[i])
x_phi_ticklabels.append(x_phi[i])
i += step
x_phi_ticks.append(x_ut[-1])
x_phi_ticklabels.append(x_phi[-1])
# plot'em all
fig, ax1 = plt.subplots()
ax1.plot(x_ut, y_brightness, marker='o', label='apparent brightness')
ax1.xaxis.set_major_locator(dates.MinuteLocator(interval=1))
ax1.xaxis.set_major_formatter(dates.DateFormatter('%H:%M'))
ax1.tick_params(axis='x', rotation=45)
ax1.minorticks_on()
ax1.legend()
ax1.grid(which='major', linestyle='-', color='#000000')
ax1.grid(which='minor', linestyle='--')
ax1.set_xlabel('time [h:m, UT]')
ax1.set_ylabel('apparent brightness [mag, CR]')
ax2 = ax1.twiny()
ax2.set_xlim(ax1.get_xlim())
ax2.set_xticks(x_phi_ticks)
ax2.set_xticklabels(x_phi_ticklabels)
ax2.set_xlabel('phase angle (phi) [deg]')
plt.gca().invert_yaxis()
plt.tight_layout(pad=0)
plt.show()