我有一个像这样的数据框:
structure(list(header = 1:10, ST.adk.fumC.gyrB.icd.mdh.purA.recA = c(" 10 10 11 4 8 8 8 2",
" 48 6 11 4 8 8 8 2", " 58 6 4 4 16 24 8 14", " 88* 6* 4 12 1 20 12 7",
" 117 20 45 41 43 5 32 2", " 7036 526 7 1 1 8 71 6", " 101 43 41 15 18 11 7 6",
" 3595 112 11 5 12 8 88 86", " 117 20 45 41 43 5 32 2", " 744 10 11 135 8 8 8 2"
)), row.names = c(NA, -10L), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"
))
我想要做的是将第二列拆分为单独的列,并用“。”分隔。在列名称中。但是,并不总是知道该列的名称是什么,这就是为什么我不能在dplyr的“单独”函数中使用该列的名称。
我尝试了以下操作:
library(dplyr)
library(stringr)
library(tidyr)
# get new column names
ids <- unlist(strsplit(names(df)[-1],
split = ".",
fixed = TRUE))
# get name of column to split
split_column <- names(df)[-1]
df %>%
separate(split_column, into = ids, extra = "merge")
这在我正在使用的脚本文件中有效,但是当我获取脚本源时,出现以下错误:
Error: `var` must evaluate to a single number or a column name, not a character vector
当我像在RStudio中一样正常运行它时,为什么这样做有效,但是当我提供脚本源时却抛出此错误? 另外,这是将未知名称的列实际拆分为具有未知名称的新列的最佳方法吗?
我在另一个脚本文件中使用以下代码来获取脚本:
system(paste("Rscript script.R", opt$m, opt$o))
其中opt $ m和opt $ o是目录路径。可以与我拥有的类似脚本一起使用,但上面的脚本会引发错误。
我希望有某种功能,例如Separate_at,但目前还不存在。
答案 0 :(得分:1)
您可以使用strsplit()
。
split <- do.call(rbind, strsplit(gsub("\\*", "", df[, -1]), " "))[, -1]
df1 <- data.frame(df[, 1], split)
df1[] <- lapply(df1, function(x) as.numeric(as.character(x)))
names(df1) <- unlist(strsplit(names(df), split = ".", fixed=TRUE))
> df1
header ST adk fumC gyrB icd mdh purA recA
1 1 10 10 11 4 8 8 8 2
2 2 48 6 11 4 8 8 8 2
3 3 58 6 4 4 16 24 8 14
4 4 88 6 4 12 1 20 12 7
5 5 117 20 45 41 43 5 32 2
6 6 7036 526 7 1 1 8 71 6
7 7 101 43 41 15 18 11 7 6
8 8 3595 112 11 5 12 8 88 86
9 9 117 20 45 41 43 5 32 2
10 10 744 10 11 135 8 8 8 2
数据
df <-structure(list(header = 1:10, ST.adk.fumC.gyrB.icd.mdh.purA.recA = c(" 10 10 11 4 8 8 8 2",
" 48 6 11 4 8 8 8 2", " 58 6 4 4 16 24 8 14", " 88* 6* 4 12 1 20 12 7",
" 117 20 45 41 43 5 32 2", " 7036 526 7 1 1 8 71 6", " 101 43 41 15 18 11 7 6",
" 3595 112 11 5 12 8 88 86", " 117 20 45 41 43 5 32 2", " 744 10 11 135 8 8 8 2"
)), row.names = c(NA, -10L), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"
))
答案 1 :(得分:0)
与您的示例几乎相同的解决方案,但有一些调整。假设您要删除以下各列中的print(np.arange((len(df) // N + 1) * N).reshape(-1, N))
[[ 0 1 2 3 4]
[ 5 6 7 8 9]
[10 11 12 13 14]
[15 16 17 18 19]]
print (np.arange((len(df) // N + 1) * N).reshape(-1, N)[:, -M:])
[[ 2 3 4]
[ 7 8 9]
[12 13 14]
[17 18 19]]
print (np.arange((len(df) // N + 1) * N).reshape(-1, N)[:, -M:].ravel())
[ 2 3 4 7 8 9 12 13 14 17 18 19]
print(np.intersect1d(df.index, pos))
[ 2 3 4 7 8 9 12 13 14]
,这就是我要这样做的方式:
'*'
给您
library(tidyverse)
library(hablar)
# Vector of new column names
ids <- simplify(strsplit(names(df)[-1],
split = ".",
fixed = T))
# Seperate second column
df %>%
mutate_at(2, funs(trimws(gsub("\\*", "", .)))) %>%
separate(2, into = ids, extra = "merge", sep = " ") %>%
retype()