我正在尝试使用qAlign函数进行亚硫酸氢盐比对。这是我的命令：
align <- qAlign("/analysis/SampleFile.txt","/analysis/refgenome.fa",aligner="Rbowtie",bisulfite="dir",alignmentParameter=" -m 3 -v 5 --best --strata")
无论参数是什么，无论何时传递对齐参数，我总是会遇到以下错误：
Error in checkForRemoteErrors(val) :
one node produced an error: Error on server.whorke.de processing sample /testread.fasta : bowtie (CtoT) failed to perform the alignments.
有什么建议吗？
谢谢！
最好， 阿米尔（Amer）