Question

我正在尝试为Bokeh中的节点和边缘获得单独的悬停工具提示，但未能使其正常工作。有人可以指出我做错了吗？我认为代码应如下所示：

from bokeh.io import show, output_notebook
from bokeh.models import Plot, Range1d, MultiLine, Circle, HoverTool
from bokeh.models.graphs import from_networkx, NodesAndLinkedEdges, EdgesAndLinkedNodes
import networkx as nx
output_notebook()

# Generate data
G = nx.karate_club_graph()
nx.set_edge_attributes(G, nx.edge_betweenness_centrality(G), "betweenness_centrality")

# Setup plot
plot = Plot(plot_width=400, plot_height=400,
            x_range=Range1d(-1.1, 1.1), y_range=Range1d(-1.1, 1.1))

graph_renderer = from_networkx(G, nx.spring_layout, scale=1, center=(0, 0))
graph_renderer.node_renderer.glyph = Circle(size=15)
graph_renderer.edge_renderer.glyph = MultiLine(line_alpha=0.8, line_width=1)

plot.renderers.append(graph_renderer)

# Add hover
node_hover_tool = HoverTool(renderers=[graph_renderer.node_renderer], 
                            tooltips=[("index", "@index"), ("club", "@club")])
edge_hover_tool = HoverTool(renderers=[graph_renderer.edge_renderer], 
                            tooltips=[("betweenness_centrality", "@betweenness_centrality")],
                            line_policy="interp")

plot.add_tools(node_hover_tool, edge_hover_tool)

# Show
show(plot)

但是我没有看到任何悬停的地方。我已经尝试了一些方法来解决此问题：

如果我删除了renderers参数，我可以将鼠标悬停在上面，但并不特定于我想要的字形。
如果我从两个renderers中都删除了HoverTool参数，则可以在节点上获得正确的工具提示以及betweenness_centrality: ??
如果我同时从两个renderers中删除了HoverTool参数，并添加了graph_renderer.inspection_policy = NodesAndLinkedEdges()，则节点上的工具提示正确
如果我同时从两个renderers中删除了HoverTool参数并添加了graph_renderer.inspection_policy = EdgesAndLinkedNodes()，那么边缘上的工具提示正确了。

我相信之前在Google论坛here上曾问过这个问题，但没有得到答案。

感谢您的帮助！

Answer 1

因此，我们以不同的方式构建网络，但是我只是使用来自networkx的一个Bokeh渲染网络解决了这个问题。

我这样做的方法是通过使用此处另一个问题概述的lines_source方法生成具有所需networkx数据的数据帧，从而为您提供：

....
plot = figure(
    plot_width=1100, plot_height=700,
    tools=['tap','box_zoom', 'reset']
)  # This is the size of the widget designed.

# This function sets the color of the nodes, but how to set based on the
# name of the node? 
r_circles = plot.circle(
    'x', 'y', source=nodes_source, name= "Node_list",
    size="_size_", fill_color="_color_", level = 'overlay', 
) 

hover = HoverTool(
    tooltips=[('Name', '@name'),('Members','@Members')],
    renderers=[r_circles]
)  # Works to render only the nodes tooltips

def get_edges_specs(_network, _layout): 
    d = dict(xs=[], ys=[], alphas=[],from_node=[],to_node=[])
    weights = [d['weight'] for u, v, d in _network.edges(data=True)]
    max_weight = max(weights)
    calc_alpha = lambda h: 0.1 + 0.6 * (h / max_weight)
    for u, v, data in _network.edges(data=True):
        d['xs'].append([_layout[u][0], _layout[v][0]])
        d['from_node'].append(u)
        d['to_node'].append(v)
        d['ys'].append([_layout[u][1], _layout[v][1]])
        d['alphas'].append(calc_alpha(data['weight']))
    return d

lines_source = ColumnDataSource(get_edges_specs(network, layout))

r_lines = plot.multi_line(
    'xs', 'ys',
    line_width=1.5, alpha='alphas', color='navy',
    source=lines_source
)  # This function sets the color of the edges

然后，我生成了一个悬停工具来显示所需的边缘信息，因此，在我的情况下，我想知道'from node'属性。我还想给它起一个崇高的名字，所以工具提示将显示“ Whered_ya_come_from”

hover2 = HoverTool(
    tooltips=[('Whered_ya_come_from','@from_node')],
    renderers=[r_lines]
)

然后我们实现它的唯一区别是，您尝试将其作为对图的一次添加，而我将它们一个接一个地绘制。

plot.tools.append(hover1)
# done to append the tool at the end because it has a problem getting
# rendered, as it depended on the nodes being rendered first. 
plot.tools.append(hover2)

从那里，您可以将其导出或呈现为HTML文件（我的首选方法）。

Bokeh中的单独的节点和边缘悬停工具？

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