基于单独的数据框(R)的子集数据

时间:2018-11-15 16:54:20

标签: r subset

我知道之前曾有人问过这个问题的变体,并且尝试过(Select rows from a data frame based on values in a vector)和(subset a column in data frame based on another data frame/list)的解决方案,但我无法使这些解决方案生效。解决方案不断返回具有0个观察值的数据帧。

我的第一个数据框看起来像这样:

> head(test3)
  long    lat     time   precip  GID_0   GID_1   HASC_1
168.75 -46.25 Jan_1979 5.534297   NZL  NZL.14_1  NZ.SO
171.25 -43.75 Jan_1979 4.191629   NZL  NZL.3_1   NZ.CA
146.25 -41.25 Jan_1979 3.139199   AUS  AUS.9_1   AU.TS
173.75 -41.25 Jan_1979 1.770889   NZL  NZL.8_1   NZ.MA
176.25 -38.75 Jan_1979 2.257812   NZL  NZL.17_1  NZ.WK
141.25 -36.25 Jan_1979 1.985313   AUS  AUS.10_1  AU.VI

我有一个单独的数据框,其中包含具有ID值的单列,如下所示:

> head(africa_iso)
ISO
DZA
AGO
SHN
BEN
BWA
BFA

我想过滤第一个数据框,以便仅保留在GID_0和ISO上匹配的观测值(从概念上讲,第一个数据集包括所有国家的观测值,我想将此数据过滤为包含来自非洲的观测值的数据集仅限国家/地区)。我目前在第一个数据帧中有725,517个观测值,经过过滤后,我希望有大约200k观测值。

到目前为止,这是我的尝试,每次我留下一个新的数据框时,该数据框将包含7列且无观测值。

Afr <- subset(test3, GID_0 %in% africa_iso$ISO) #attempt 1

Afr <- setDT(test3)[GID_0 %in% africa_iso$ISO] #attempt 2

Afr <- test3[test3$GID_0 %in% africa_iso$ISO,] #attempt 3

Afr <- filter(test3$GID_0 %in% africa_iso$ISO  ) #attempt 4

Afr <- setDT(test3)[GID_0 %chin% africa_iso$ISO] #attempt 5

Afr <- test3[match(test3$GID_0, africa_iso$ISO),] #attempt 6

Afr <-test3[is.element(test3$GID_0, africa_iso$ISO),] #attempt 7

我确定对于其他人来说这是一个小问题,但我将不胜感激。谢谢。

编辑:

> str(test3)
Classes ‘data.table’ and 'data.frame':  725517 obs. of  7 variables:
 $ long  : num  169 171 146 174 176 ...
 $ lat   : num  -46.2 -43.8 -41.2 -41.2 -38.8 ...
 $ time  : Factor w/ 477 levels "Jan_1979","Feb_1979",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1        
 $ precip: num  5.53 4.19 3.14 1.77 2.26 ...
 $ ISO   :'data.frame': 725517 obs. of  1 variable:
..$ : chr  "NZL" "NZL" "AUS" "NZL" ...
 $ ISOP  :'data.frame': 725517 obs. of  1 variable:
..$ : chr  "NZL.14_1" "NZL.3_1" "AUS.9_1" "NZL.8_1" ...
 $ HASC  :'data.frame': 725517 obs. of  1 variable:
..$ : chr  "NZ.SO" "NZ.CA" "AU.TS" "NZ.MA" ...
- attr(*, ".internal.selfref")=<externalptr> 

还有

> str(africa_iso)
'data.frame':   62 obs. of  1 variable:
 $ ISO: Factor w/ 57 levels "AGO","BDI","BEN",..: 14 1 43 3 5 4 2 8 12 6 ...

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

test3中的几列是不正确的character:它们被嵌入data.frame中,这使查找变得复杂。如果您不是故意这样做,则可以使用以下方法进行纠正:

isdf <- sapply(test3, is.data.frame)
test3[isdf] <- lapply(test3[isdf], `[[`, 1)
subset(test3, GID_0 %in% africa_iso$ISO)
#     long    lat     time   precip GID_0    GID_1 HASC_1
# 1 168.75 -46.25 Jan_1979 5.534297   NZL NZL.14_1  NZ.SO
# 2 171.25 -43.75 Jan_1979 4.191629   NZL  NZL.3_1  NZ.CA
# 4 173.75 -41.25 Jan_1979 1.770889   NZL  NZL.8_1  NZ.MA
# 5 176.25 -38.75 Jan_1979 2.257812   NZL NZL.17_1  NZ.WK

我以前将您的africa_iso更改为包括NZL,以便进行匹配:

> dput(africa_iso)
structure(list(ISO = structure(c(5L, 1L, 6L, 2L, 4L, 3L), .Label = c("NZL", 
"BEN", "BFA", "BWA", "DZA", "SHN"), class = "factor")), row.names = c(NA, 
-6L), class = "data.frame")