在Python中每行的末尾附加随机的True或False

时间:2018-11-13 18:22:11

标签: python bioinformatics python-3.7

我有一个按行和列组织的文本文件。这是文件示例

ATOM      1  N   MET A   0       7.721  14.287  22.993  1.00 56.77           N  
ATOM      2  CA  MET A   0       8.721  15.393  22.939  1.00 56.81           C  
ATOM      3  C   MET A   0      10.044  14.985  23.585  1.00 54.96           C  
ATOM      4  O   MET A   0      11.059  15.660  23.408  1.00 56.23           O  
ATOM      5  CB  MET A   0       8.167  16.640  23.642  1.00 59.72           C  
ATOM      6  CG  MET A   0       7.207  16.349  24.796  1.00 62.33           C  
ATOM      7  SD  MET A   0       5.772  17.459  24.822  1.00 66.48           S  

我想做的是在每行的末尾添加 random 是或否,最好是在其自己的列中,看起来像这样

ATOM      1  N   MET A   0       7.721  14.287  22.993  1.00 56.77           N    True
ATOM      2  CA  MET A   0       8.721  15.393  22.939  1.00 56.81           C    False
ATOM      3  C   MET A   0      10.044  14.985  23.585  1.00 54.96           C    False
ATOM      4  O   MET A   0      11.059  15.660  23.408  1.00 56.23           O    False
ATOM      5  CB  MET A   0       8.167  16.640  23.642  1.00 59.72           C    True
ATOM      6  CG  MET A   0       7.207  16.349  24.796  1.00 62.33           C    False
ATOM      7  SD  MET A   0       5.772  17.459  24.822  1.00 66.48           S    False

这是我为实现此目的而编写的功能

def random_TF(pdbFileName): #This function will randomly generate TRUE or FALSE
    with open(pdbFileName, 'r') as e:
        with open('1fkqTF.txt', 'w') as f:
            for i, line in enumerate(e):
                line = line.rstrip('\n')
                line += str(random.choice([True, False]))

    e.close()
    f.close()

但是,当我调用该函数时,它将返回一个空白文本文件。

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您忘记了f.write(line)。我添加了'\ n'和'\ t'来改善格式。

def random_TF(pdbFileName): #This function will randomly generate TRUE or FALSE
with open(pdbFileName, 'r') as e:
    with open('text2.txt', 'w') as f:
        for i, line in enumerate(e):
            line = line.rstrip('\n')
            line += '\t' + str(random.choice([True, False])) + '\n'
            f.write(line)

e.close()
f.close()

答案 1 :(得分:1)

您实际上不是在写文件。您需要致电:

f.write(line + "\n")

更新该行之后。

此外,您无需调用e.close()f.close(),这是使用上下文管理器with的优势。

最后,也许可以使用诸如pandas之类的适当数据操作库来完成您正在做的事情的更好方法,但是如果没有其他有关执行此操作的背景的信息,将很难提供很多见解