Question

我尝试了多种方法在R中安装caret软件包。我收到的错误消息如下：

错误：在loadNamespace（j <-i [[1L]]，c（lib.loc，.libPaths（）），versionCheck = vI [[j]]）中，对于“插入符”的包或名称空间加载失败：没有名为“ dimRed”的软件包

当我尝试安装dimRed时，出现以下消息：

Installing package into ‘C:/Users/Thomas/Documents/R/win-library/3.4’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  dependency ‘Biobase’ is not available

  There is a binary version available but the source version is later:
   binary source needs_compilation
dimRed  0.1.0  0.2.1             FALSE

installing the source package ‘dimRed’

trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/dimRed_0.2.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 363025 bytes (354 KB)
downloaded 354 KB

错误：依赖项“ Biobase”不适用于软件包“ dimRed”   *删除'C：/Users/Thomas/Documents/R/win-library/3.4/dimRed'   在R CMD安装   install.packages中的警告：     运行命令'“ C：/PROGRA~1/R/R-34~1.4/bin/x64/R” CMD安装-l“ C：\ Users \ Thomas \ Documents \ R \ win-library \ 3.4” C：\ Users \ Thomas \ AppData \ Local \ Temp \ RtmpqKhsKn / downloaded_packages / dimRed_0.2.1.tar.gz'的状态为1   install.packages中的警告：     安装软件包“ dimRed”的退出状态为非零

已下载的源包位于       ‘C：\ Users \ Thomas \ AppData \ Local \ Temp \ RtmpqKhsKn \ downloaded_packages'

根据以前的帖子，我已经更新了RStudio。我尝试从install_url安装。

欢迎提出任何建议。

Answer 1

我能够弄清楚这一点。只需键入install.packages将不起作用。为了安装Biobase，您必须在R控制台中运行以下代码：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("Biobase", version = "3.8")

更多信息：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/Biobase.html

完成此步骤后，我将再次使用插入符号

install.packages("caret",dependencies = T)

然后它起作用了。

Answer 2

警告...

install.packages("BiocManager")

这仅在您的R版本为> = 3.5.0时有效

有关信息，在Centos和Windows下我也有同样的问题。在Windows 3.5.1 R版本上解决的问题。在centOS（3.4.2）上尚未解决

无法在R中安装插入符号包

2 个答案: