将numpy数组附加到文本文件中

Question

我有一个返回二维numpy数组的函数，该函数将在循环内。在每次迭代时，我都希望将此numpy数组附加到文件中。

filename = "xyz"
for i in range(10):
      np_array = function_to_get_numpy()
      now append this `np_array` into filename

我可以继续在脚本中追加numpy数组并转储一次，但是我想避免这种情况。

我也希望以非二进制格式存储它。

Answer 1

In [64]: with open('xyz','w') as f:
    ...:     for n in range(1,4):
    ...:         arr = np.arange(n*n).reshape(n,n)
    ...:         np.savetxt(f, arr, fmt='%5d', delimiter=',')
    ...:         
In [65]: cat xyz
    0
    0,    1
    2,    3
    0,    1,    2
    3,    4,    5
    6,    7,    8

如果列数变化（如此处所做的那样），将很难读取。 csv这样的genfromtxt读者会不喜欢它。

如果列数一致，则可以将其作为一个大数组加载。可以分开写入并重新装入它们，但是涉及更多。

Answer 2

我将借此机会插入nppretty，这是我一直在努力的用于numpy的漂亮打印机。它提供了一个ArrayStream类，我认为它将完全满足您的需求。

通过以下方式安装nppretty：

pip install nppretty

您可以像使用文件对象一样使用ArrayStream。例如，这段代码：

from nppretty import ArrayStream
import numpy as np

arrstr = ArrayStream('arraystream.txt', name='arr2D')
for i in range(10):
    arr = np.arange(10*i, 10*(i + 1))
    arrstr.write(arr.reshape(2,5))
arrstr.close()

将产生一个名为arraystream.txt的文本文件，其内容如下：

arr2D = [
[0, 1, 2, 3, 4],
[5, 6, 7, 8, 9],
[10, 11, 12, 13, 14],
[15, 16, 17, 18, 19],
[20, 21, 22, 23, 24],
[25, 26, 27, 28, 29],
[30, 31, 32, 33, 34],
[35, 36, 37, 38, 39],
[40, 41, 42, 43, 44],
[45, 46, 47, 48, 49],
[50, 51, 52, 53, 54],
[55, 56, 57, 58, 59],
[60, 61, 62, 63, 64],
[65, 66, 67, 68, 69],
[70, 71, 72, 73, 74],
[75, 76, 77, 78, 79],
[80, 81, 82, 83, 84],
[85, 86, 87, 88, 89],
[90, 91, 92, 93, 94],
[95, 96, 97, 98, 99],
]

关于ArrayStream的注释

ArrayStream接受与标准Python open方法相同的所有参数。另外一个关键字arg为name，它设置文件中数组的名称（name如果留空，则默认为"array"）。就像调用open返回的文件对象一样，ArrayStream实例可以在with语句中使用。例如，以下代码将产生与上面相同的输出：

with ArrayStream('arraystream.txt', name='arr2D') as f:
    for i in range(10):
        arr = np.arange(10*i, 10*(i + 1))
        f.write(arr.reshape(2,5))