控制seqLogo输出的大小?

时间:2011-03-16 12:07:30

标签: r bioinformatics sequence-diagram

我正在使用seqLogo包来绘制一些序列Logos。我需要使徽标更宽,默认绘图使徽标变成方形图。有没有办法做到这一点?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您可以从seqLogo查看代码:

> library(seqLogo)
> seqLogo
function (pwm, ic.scale = TRUE, xaxis = TRUE, yaxis = TRUE, xfontsize = 15, yfontsize = 15)
{                                                                                                                                                                                                                                             
    if (class(pwm) == "pwm") {
        pwm <- pwm@pwm
    }
    ...
}
<environment: namespace:seqLogo>
> 

其中有控制渲染的参数,您可以通过编辑功能代码进行调整。请参阅this SO answer以了解fix()功能。