cytoscape显示沿动画路径的节点之间的流量

Question

我需要展示事物在节点之间沿着其连接路径移动的过程，类似于this project。我还没有在cytoscape中找到它的任何示例，但是我过去曾经使用cytoscape，并且更喜欢继续使用它。我将对如何解决此问题提出建议。

Answer 1

您有一些选择...

1. 最简单的是Marquee视觉样式。它在有向边缘的方向上产生“行军蚁”错觉。只需转到“控制面板”中的“样式”选项卡，然后选择“字幕”样式。在“边缘”选项卡中，可以从3种不同的选取框线类型中进行选择。例如，您可以想象将这3种线型映射到3种交通密度类别（或箱）。或者，您可以将颜色，厚度和/或透明度与选取框样式结合使用以表示交通密度。您可以在此处查看示例：

   • https://youtu.be/MF0zsxEPoPc?t=44

2. 还有一个动画应用程序！这采用在您提供的任何关键帧集之间插入任何视觉样式（包括位置和存在）的方法。因此，例如，您将有一个开始和结束帧，然后CyAnimator将为您制作一个电影文件：

   • http://apps.cytoscape.org/apps/cyanimator

3. 还有另一种完全不同的方法：借助Cytoscape的脚本功能，您几乎可以做任何您想做的事情。例如，RCy3软件包的单元测试最终几乎是一种迷惑的数据可视化显示（并且单元测试甚至没有完全覆盖， shame ）。因此，您可以使用R或Python中的一些脚本来实时指挥自己的动画。这是RCy3单元测试演示，并链接到脚本库：

   • https://www.youtube.com/watch?v=IXqbdlUnzUE&t=1s（警告：图形闪烁）
   • https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/RCy3.html
   • https://py2cytoscape.readthedocs.io/en/latest/

Answer 2

我正在将cytoscape.js与meteor.js结合使用。我的元素，样式表和车辆（显示为红点）存储在mongo中，可以通过外部过程进行更新或在屏幕上进行编辑。该图可以即时进行重组或重塑，车辆将发现新的成本最低的路线以达到目标。移动通过eles.animate()排队，路由由eles.floydWarshall().path()处理。这可能与您的想法类似。