我正在尝试通过光栅包中的简单计算操作(将温度从开尔文转换为摄氏度)在R中处理数千个GeoTIFF图像。
计算正常,但是我需要原始输入文件名作为输出,以便随后分配图像。
使用我当前的代码,仅采用列表中的第一个文件名,而输出文件将被不断覆盖。
具有使用“ calc”的路径的完整文件列表:
library(raster)
files <- list.files(path="myInputPath",
pattern="1km.tif$",
full.names=T)
没有用于命名输出数据的路径的文件名列表:
filenames <- list.files(path="myInputPath",
pattern="1km.tif$",
full.names=F)
两个循环来处理数据并命名输出:
for(j in seq(filenames)){
for(i in seq(files)){
celsius <- calc(x=raster(files[i]), fun=function(x){x*0.02-273.15})
writeRaster(celsius,
filename=paste0("myOutputPath",#path where the data should be stored
filenames[j],#filenames from list
"_celsius",#suffix to distinguish from input data
".tif"),
overwrite=T)
}
}
答案 0 :(得分:0)
好吧,您是否意识到您要重新处理每个文件的次数与拥有文件的次数一样?也就是说,尽管您只需要执行i^j
次,但这两个循环的内部执行i^2
次(即i
)。
如何(未经过实际测试)
infiles <- list.files(path="myInputPath",
pattern="1km.tif$",
full.names=TRUE)
outfiles <- file.path("myOutputPath", paste0(basename(infiles), "_celsius.tif"))
for (j in seq_along(infiles)) {
celsius <- calc(x=raster(infiles[j]), fun=function(x) x*0.02-273.15)
writeRaster(celsius, filename=outfiles[j], overwrite=TRUE)
}