小提琴图显示观察ggplot的数量

时间:2018-11-06 13:46:56

标签: r ggplot2 violin-plot

我正在R中使用ggplot创建小提琴图。我想创建这样的小提琴图,在每个图中显示不同的数字。 enter image description here

我用这段代码创建了这样的情节。

data<-read.csv("Clinical violion file.csv")
mat <- reshape2::melt(data.frame(data), id.vars = NULL)
pp <- ggplot(mat, aes(x = variable, y = value)) + geom_violin(scale="width",adjust = 1,width = 0.5,aes(color=factor(variable)))+ geom_point() 
pp

我有这样的情节。

但是我不知道如何在每个图中添加显示不同数字的点。 这是我文件的标题。

我通过这样做解决了这个问题。

 library(ggbeeswarm)
pp <- ggplot(mat, aes(x = variable, y = value)) + geom_violin(scale="width",adjust = 1,width = 0.5,aes(color=factor(variable)))+geom_quasirandom(aes(color=factor(variable)),groupOnX=FALSE)

1 个答案:

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这应该做您想要的:

library(ggplot2)

head(iris)

iris %>%  group_by(Species) %>% summarise(n=n(), avg = mean(Sepal.Length)) ->Summary.data


ggplot(iris,aes(x=Species,y=Sepal.Length)) + geom_violin(trim = T) +
  geom_jitter(height = 0, width = 0.1) +
  geom_text(data=Summary.data ,aes(x = Species, y = avg, label=n),color="red", fontface =2, size = 5)

Result