Question

我有一个从我的代码生成的点文件，并希望在我的输出中呈现它。为此，我在网上看到命令在cmd

上是这样的

dot -Tpng InputFile.dot -o OutputFile.png  for Graphviz

但我的问题是我想在我的python程序中使用它。

我该怎么办？

我看着pydot但似乎无法在那里找到答案.....

Answer 1

使用pydot.graph_from_dot_file加载文件以获取pydot.Dot类实例。然后使用write_png方法将其写入PNG文件。

import pydot

(graph,) = pydot.graph_from_dot_file('somefile.dot')
graph.write_png('somefile.png')

Answer 2

pydot无论如何都需要安装GraphViz二进制文件，所以如果你已经生成了你的点文件，你也可以直接自己调用点。例如：

from subprocess import check_call
check_call(['dot','-Tpng','InputFile.dot','-o','OutputFile.png'])

Answer 3

您可以使用pygraphviz。加载图表后，即可

graph.draw('file.png')

Answer 4

您可以尝试：

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'
os.system('dot -Tpng random.dot -o random.png')

Answer 5

您可以使用graphviz：

# Convert a .dot file to .png
from graphviz import render
render('dot', 'png', 'fname.dot')

# To render an existing file in a notebook
from graphviz import Source
Source.from_file("fname.dot")

Answer 6

第一个解决方案）

使用@Mauricio Carrero的方法通过在脚本内设置PATH（在环境变量中设置相同的PATH不会产生这种作用！）来实现：

import os
import pydotplus
from sklearn.tree import export_graphviz

os.environ['PATH'] = os.environ['PATH']+';' + r'C:\Users\Admin\Anaconda3\Library\bin\graphviz'

# first export the dot file only if needed
export_graphviz(clf, out_file=filename + ".dot", feature_names = feature_names)
# now generate the dot_data again
dot_data = export_graphviz(clf, out_file=None, feature_names = feature_names)
graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)
graph.write_png(filename + "_gv.png")

这使得可以将dot_data保存为png。选择自己的本地路径，您可能还已经在`C：/ Program Files（x86）/Graphviz2.38/bin /

中安装了graphviz

此解决方案也来自Sarunas的回答： https://datascience.stackexchange.com/questions/37428/graphviz-not-working-when-imported-inside-pydotplus-graphvizs-executables-not

第二个解决方案）

您还可以避免错误

Exception has occurred: InvocationException
GraphViz's executables not found

通过简单地提供它想要的内容，因为它需要graphviz对象的可执行文件：

graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)
# graph is now a new Dot object!
# That is why we need to set_graphviz_executables for every new instance
# This cannot be set globally but must be set again and again
# that is why the PATH solution (1st Solution) above seems much better to me
# see the docs in https://pydotplus.readthedocs.io/reference.html
pathCur = 'C:\\Program Files (x86)\\Graphviz2.38\\bin\\'
graph.set_graphviz_executables({'dot': pathCur+'dot.exe', 'twopi': pathCur +'twopi.exe', 'neato': pathCur+'neato.exe', 'circo': pathCur+'circo.exe', 'fdp': pathCur+'fdp.exe'})
graph.write_png(filename + "_gv.png")

p.s：这2种方法是在校准erroneuos安装并完全卸载并重新安装2小时，所有种类的PATH变量，外部和内部graphviz安装，python-graphviz，pygraphviz以及我可以在中找到的所有解决方案之后的两个小时，对我而言唯一的解决方案在这里或在 Convert decision tree directly to png 或在 https://datascience.stackexchange.com/questions/37428/graphviz-not-working-when-imported-inside-pydotplus-graphvizs-executables-not?newreg=a789aadc5d4b4975949afadd3919fe55

对于conda python-graphviz，我经常遇到类似

的安装错误

InvalidArchiveError('Error with archive C:\\Users\\Admin\\Anaconda3\\pkgs\\openssl-1.1.1d-he774522_20ffr2kor\\pkg-openssl-1.1.1d-he774522_2.tar.zst.  You probably need to delete and re-download or re-create this file.  Message from libarchive was:\n\nCould not unlink')

对于conda安装graphviz，我得到了

InvalidArchiveError('Error with archive C:\\Users\\Admin\\Anaconda3\\pkgs\\openssl-1.1.1d-he774522_21ww0bpcs\\pkg-openssl-1.1.1d-he774522_2.tar.zst.  You probably need to delete and re-download or re-create this file.  Message from libarchive was:\n\nCould not unlink')

pygraphviz需要我不想安装的MS Visual C ++：

error: Microsoft Visual C++ 14.0 is required. Get it with "Microsoft Visual C++ Build Tools": https://visualstudio.microsoft.com/downloads/

最后，除第一种解决方案方法外，没有任何指南可以真正正确设置PATH变量。

Answer 7

在python中将点转换为png的最简单方法是：

从graphviz导入渲染

render（'dot'，'png'，'filename.dot'）

答案是受Sam Perry启发

在python中将点转换为png

7 个答案: