软件包“ inSilicoDb”不可用(对于R版本3.5.1)

时间:2018-11-05 07:31:39

标签: bioconductor

我无法安装inSilicoDb。我收到此消息:

  

source(“ https://bioconductor.org/biocLite.R”)   Bioconductor 3.8版(BiocInstaller 1.32.1),? biocLite寻求帮助   biocLite(“ inSilicoDb”)   BioC_mirror:https://bioconductor.org   使用Bioconductor 3.8(BiocInstaller 1.32.1),R 3.5.1(2018-07-02)。   安装“ inSilicoDb”软件包   旧包装:“格子”   更新全部/部分/无? [a / s / n]:   s   晶格:    安装在/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library中的0.20-35版    可在https://cran.rstudio.com上获得0.20-38版   更新? (是/否/取消)是

有二进制版本可用,但源版本   稍后: 二进制sourceneeds_compilation 点阵0.20-35 0.20-38是

您是否要从源安装需要编译的软件包? (是/否/取消) 安装源程序包“ lattice”

尝试网址“ https://cran.rstudio.com/src/contrib/lattice_0.20-38.tar.gz

内容类型'application / x-gzip'长度359031字节(350 KB)

下载了350 KB

  • 安装 source 软件包“ lattice” ... **包裹“格子”已成功解包,并检查了MD5的总和 **库 xcrun:错误:无效的活动开发人员路径(/ Library / Developer / CommandLineTools),缺少xcrun,位于:/ Library / Developer / CommandLineTools / usr / bin / xcrun 错误:包“ lattice”的编译失败
  • 删除“ /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/lattice”
  • 还原以前的“ /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/lattice”

已下载的源包位于     ‘/ private / var / folders / bp / fpj_rv5x76zb7j28l89g2hb40000gn / T / RtmpQj1iBm / downloaded_pa​​ckages’ 警告信息: 1:不建议使用“ biocLite”。 请改用“ BiocManager :: install”。 查看帮助(“已弃用”) 2:软件包“ inSilicoDb”不可用(对于R版本3.5.1) 3:在install.packages(update [instlib == l,“ Package”],l,repos = repos,中:   软件包“ lattice”的安装退出状态为非零

  

BiocManager :: install(“ inSilicoDb”)   Bioconductor版本3.8(BiocManager 1.30.3),R 3.5.1(2018-07-02)   安装软件包“ inSilicoDb”   更新旧软件包:“ lattice”   更新全部/部分/无? [a / s / n]:   ñ   警告信息:   软件包“ inSilicoDb”不可用(对于R版本3.5.1)

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