rMATS错误“无法访问共享库”

时间:2018-11-05 02:40:09

标签: centos conda blas openblas rna-seq

我正在尝试在Linux(CentOS)群集上运行rMATS。在此系统上,我没有root用户访问权限。我使用anaconda conda install软件包管理器安装了几个rMATS依赖软件包。

rMATS无法访问系统上的共享库libblas.so.3,并引发错误rMATSexe: error while loading shared libraries: libblas.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory

尽管我已经在系统libblas.so.3上找到了/Users/paul/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3库,但是我不确定如何使rMATS软件将其作为“共享库”进行访问。

我尝试了export LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3,但这没用。

我可以在哪里放置这个libblas.so.3库,以便系统可以找到它?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

LD_LIBRARY_PATH是目录路径,而不是文件路径。您要这样设置:

LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib