我的数据框很大,我想根据插入号^和IMM-之后的字母这两个条件将一列分为许多列。根据下面的数据,第1列将分为名为IMM-A,IMM-B,IMM-C和IMM-W的列。我尝试了单独的功能,但是只有在您指定列名的情况下它才起作用,并且由于我的数据不一致,所以我并不总是知道列名应该是什么。
SampleId Column1
1 IMM-A*010306+IMM-A*0209^IMM-B*6900+IMM-B*779999^IMM-C*1212+IMM-C*3333
2 IMM-A*010306+IMM-A*0209^IMM-C*6900+IMM-C*779999^IMM-W*1212+IMM-W*3333
3 IMM-B*010306+IMM-B*0209^IMM-C*6900+IMM-C*779999^IMM-W*1212+IMM-W*3333
预期输出为;
SampleId IMM-A IMM-B IMM-C IMM-W
1 IMM-A*010306+IMM-A*0209 IMM-B*6900+IMM-B*779999 IMM-C*1212+IMM-C*3333
2 IMM-A*010306+IMM-A*0209 IMM-C*6900+IMM-C*779999 IMM-W*1212+IMM-W*3333
3 IMM-B*010306+IMM-B*0209 IMM-C*6900+IMM-C*779999 IMM-W*1212+IMM-W*3333
答案 0 :(得分:3)
不清楚预期的输出。根据说明,我们可能需要
library(tidyverse)
map(strsplit(df$Column1, "[*+^]"), ~
stack(setNames(as.list(.x[c(FALSE, TRUE)]), .x[c(TRUE, FALSE)])) %>%
group_by(ind) %>%
mutate(rn = row_number()) %>%
spread(ind, values)) %>%
set_names(df$SampleId) %>%
bind_rows(.id = 'SampleId') %>%
select(-rn)
# A tibble: 6 x 5
# SampleId `IMM-A` `IMM-B` `IMM-C` `IMM-W`
# <chr> <chr> <chr> <chr> <chr>
#1 1 010306 6900 1212 <NA>
#2 1 0209 779999 3333 <NA>
#3 2 010306 <NA> 6900 1212
#4 2 0209 <NA> 779999 3333
#5 3 <NA> 010306 6900 1212
#6 3 <NA> 0209 779999 3333
基于OP的预期输出,我们通过在^
分隔符处拆分'Column1',然后在分隔符处将{Column1'separate
拆分为'colA','colB'来扩展数据*
,将“ colB”和spread
删除为“宽”格式
df %>%
separate_rows(Column1, sep = "\\^") %>%
separate(Column1, into = c("colA", "colB"), remove = FALSE, sep="[*]") %>%
select(-colB) %>%
spread(colA, Column1, fill = "")
#SampleId IMM-A IMM-B IMM-C IMM-W
#1 1 IMM-A*010306+IMM-A*0209 IMM-B*6900+IMM-B*779999 IMM-C*1212+IMM-C*3333
#2 2 IMM-A*010306+IMM-A*0209 IMM-C*6900+IMM-C*779999 IMM-W*1212+IMM-W*3333
#3 3 IMM-B*010306+IMM-B*0209 IMM-C*6900+IMM-C*779999 IMM-W*1212+IMM-W*3333
df <- structure(list(SampleId = 1:3, Column1 =
c("IMM-A*010306+IMM-A*0209^IMM-B*6900+IMM-B*779999^IMM-C*1212+IMM-C*3333",
"IMM-A*010306+IMM-A*0209^IMM-C*6900+IMM-C*779999^IMM-W*1212+IMM-W*3333",
"IMM-B*010306+IMM-B*0209^IMM-C*6900+IMM-C*779999^IMM-W*1212+IMM-W*3333"
)), class = "data.frame", row.names = c(NA, -3L))