Question

我有一个R函数，该函数创建一个Primebase Cpp类，然后返回一个XPtr<Primebase>指针。

由于构建过程需要花费大量时间，因此我想将Primebase的实例保存到我的会话中，以便下次打开RI时可以直接访问Primebase实例

不幸的是，当我关闭R并且XPtr变成null pointer时，基础对象被删除了。

有没有一种方法可以防止R删除对象或以其他任何方式保存基础对象？

Answer 1

R会话结束时，由Rcpp::Xptr管理的C ++对象被破坏。如果要保存对象，则必须对其进行序列化。 Rcereal软件包提供了一种很好的可能性。下面的示例在一个构造函数中使用一个带有人工睡眠的普通Primebase类来模拟构造期间的繁重处理。检查对象的内容后，将其序列化并销毁。之后，对象被反序列化并再次包装到Xptr中。请注意，反序列化比构建便宜得多：

#include <Rcpp.h>
// [[Rcpp::plugins("cpp11")]]
// [[Rcpp::depends(Rcereal)]]
#include <cereal/archives/binary.hpp>
#include <chrono>
#include <fstream>
#include <thread>

class Primebase
{
private:
  int x;

public:
  Primebase() : x{0} {};
  Primebase(int x_) : x{x_} {std::this_thread::sleep_for(std::chrono::seconds(1));};

  int answer() {return x;}

  template <class Archive>
  void serialize(Archive & ar)
  {
    ar(x);
  }
};

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::XPtr<Primebase> create(int x) {
  Primebase* instance = new Primebase(x);
  return Rcpp::XPtr<Primebase>(instance);
}


// [[Rcpp::export]]
int answer(Rcpp::XPtr<Primebase> xptr) {
  return xptr.get()->answer();
}

// [[Rcpp::export]]
void mySerialize(Rcpp::XPtr<Primebase> xptr, std::string filename) {
  std::ofstream os(filename, std::ios::binary);
  cereal::BinaryOutputArchive archive(os);
  archive(*xptr.get());
}

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::XPtr<Primebase> myDeserialize(std::string filename) {
  std::ifstream is(filename, std::ios::binary);
  cereal::BinaryInputArchive archive(is);
  Primebase* instance = new Primebase;
  archive(*instance);
  return Rcpp::XPtr<Primebase>(instance);
}


/*** R
system.time(xptr <- create(42))
answer(xptr)
mySerialize(xptr, "test.cereal")
rm(xptr)
exists("xptr")
system.time(xptr <-myDeserialize("test.cereal")) 
answer(xptr)
*/

输出：

> system.time(xptr <- create(42))
   user  system elapsed 
  0.000   0.000   1.001 

> answer(xptr)
[1] 42

> mySerialize(xptr, "test.cereal")

> rm(xptr)

> exists("xptr")
[1] FALSE

> system.time(xptr <-myDeserialize("test.cereal")) 
   user  system elapsed 
      0       0       0 

> answer(xptr)
[1] 42

参考文献：

保留XPtr进行多个会话

1 个答案: