我有一些DICOM
和NIfTI
格式的医学MRI数据。如何将切片转换为 16位png 格式?
我在[miconv]
ubuntu软件包中尝试了mitools
(http://manpages.ubuntu.com/manpages/xenial/man1/miconv.1.html),并在GitHub上尝试了[med2image]
(https://github.com/FNNDSC/med2image)。
他们肯定可以将.nii
转换为.png
。但是,由于它们都转换为8bit
RGB
模式,因此我遭受了严重的强度损失。 原始NIfTI 通常为16bit
灰度形式。
[man page]
的{{1}}(http://manpages.ubuntu.com/manpages/xenial/man1/miconv.1.html)提到了 unsigned 16 bit 。所以我尝试了
miconv
但是输出显然不是合法的PNG文件。
或者也许我被迫使用miconv pt000_t2tse_sag.nii pt00_t2tse_sag.png -wf u16bit
(nibabel
)和pydicom
编写一个自定义的python脚本。