我正在GridSearchCV
和scikit-learn
上使用Spark
(Linux
)进行网格搜索。因此,我在nohup ./spark_python_shell.sh > output.log &
外壳上运行bash
来点燃Spark集群,并且我也使我的python脚本运行了(请参见spark-submit \ --master yarn 'grid_search.py'
):
SPARK_HOME=/u/users/******/spark-2.3.0 \
Q_CORE_LOC=/u/users/******/q-core \
ENV=local \
HIVE_HOME=/usr/hdp/current/hive-client \
SPARK2_HOME=/u/users/******/spark-2.3.0 \
HADOOP_CONF_DIR=/etc/hadoop/conf \
HIVE_CONF_DIR=/etc/hive/conf \
HDFS_PREFIX=hdfs:// \
PYTHONPATH=/u/users/******/q-core/python-lib:/u/users/******/three-queues/python-lib:/u/users/******/pyenv/prod_python_libs/lib/python2.7/site-packages/:$PYTHON_PATH \
YARN_HOME=/usr/hdp/current/hadoop-yarn-client \
SPARK_DIST_CLASSPATH=$(hadoop classpath):$(yarn classpath):/etc/hive/conf/hive-site.xml \
PYSPARK_PYTHON=/usr/bin/python2.7 \
QQQ_LOC=/u/users/******/three-queues \
spark-submit \
--master yarn 'grid_search.py' \
--executor-memory 10g \
--num-executors 8 \
--executor-cores 10 \
--conf spark.port.maxRetries=80 \
--conf spark.dynamicAllocation.enabled=False \
--conf spark.default.parallelism=6000 \
--conf spark.sql.shuffle.partitions=6000 \
--principal ************************ \
--queue default \
--name lets_get_starting \
--keytab /u/users/******/.******.keytab \
--driver-memory 10g
这是grid_search.py
python脚本的一部分,该脚本将Grid Search连接到Spark集群并执行Grid Search:
# Spark configuration
from pyspark import SparkContext, SparkConf
conf = SparkConf()
sc = SparkContext(conf=conf)
# Execute grid search - using spark_sklearn library
from spark_sklearn import GridSearchCV
classifiers_grid = GridSearchCV(sc, estimator=classifier, param_grid=parameters, scoring='precision', cv=3,n_jobs=5, pre_dispatch=10)
classifiers_grid.fit(X, y)
此网格搜索显然在Linux上创建了多个进程,并且这些进程具有不同的PID。
我的问题如下:
如何限制此网格搜索的内存使用?
例如,如何将其最大内存使用量设置为10GB?
从理论上讲,遵循三种不同的路线:
目前,我通过将n_jobs
设置为不同的值来对(1)进行了实验
和pre_dispatch
,然后检查Linux上相关进程(free -h
,ps aux --sort-rss
等)的内存使用情况。
但是,我认为这是非常低效的,因为您不能精确指定内存上限(例如10 GB),并且这些进程的内存使用量会随着时间的流逝而不断变化。结果,我必须不断关注内存使用情况,然后修改n_jobs
的值
和pre_dispatch
等。