零膨胀GAM置信带

时间:2018-10-28 16:40:19

标签: r confidence-interval gam mgcv

我正在运行一个ziplss GAM模型,并希望提取(针对95%的置信区间)响应等级的预测(即,组合计数和概率)。

我可以很容易地使用se来获得se.fit = TRUE的值来进行链接扩展,也可以使用type = "response"来获得响应预测,但是我不确定如何做到这两个。 ..任何输入将不胜感激! 这是一个使用the数据的ziplss模型。

library(mgcv)   
library(glmmTMB)
data(Salamanders)               
zipgam <- gam(list(count ~ spp * mined + s(site, bs = "re"),
                ~ spp * mined),
           data = Salamanders, family = ziplss, method = "REML")

# response preds
preds.response <- data.frame(Predict = predict(zipgam, type = "response"))
## preds and SEs of link-scale predictions...
preds.link.se <- predict(zipgam, type = "link", se.fit = TRUE)

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