Tensorflow 2d直方图

时间:2018-10-25 15:18:08

标签: python numpy tensorflow histogram distribution

我试图在tensorflow中创建2D直方图,以在tensorflow中的自定义损失函数中使用。更普遍地说,我认为人们可以通过使用神经元的共激活来受益,这需要类似的结构。

以下是我要尝试做的事情:

给出一个Nx2张量,其中N是一些样本,我想创建一个共激活的(合并的)直方图。例如,在input = [[[0,0.01],[0,0.99],[0.5,0.5]]的简单情况下,总共有10000个bin,我想生成一个100x100张量,除了3以外都为0在(0,0.01),(0,0.99)和(0.5,0.5)处输入,其中值将为1/3(缩放很容易,所以我可以改用1)。

我可以使用标准的numpy或数组操作轻松做到这一点

function person(name, age){
    this.name = name;
    this.age = age;
}

persons = [];

persons.push(new person("Alex", 15));
persons.push(new person("John", 16));
persons.push(new person("Billy", 13));
persons.push(new person("Bob", 11));

if(persons.some(p => p.age < 14)){
    document.write("oops!");
}
else{
    document.write("yay!");
}

但是,如果我想在tensorflow中使用hist_2d作为损失函数的一部分,看来我无法进行这种迭代。

有人知道我要寻找的二维直方图的好方法吗?我很高兴找到tf.histogram_fixed_width(),但这仅生成1d直方图。我已经开始研究tf.while_loop()和tf.map_fn()了,但是我对Tensorflow还是很陌生,所以我不确定哪种途径最有前途。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

发布一个我想出的“答案”,更像是一种解决方法。

我想要创建2D直方图的全部原因是我想计算两个神经元激活的联合分布的熵。我已经将激活值离散化为bin,所以可以将分布随机调整,因为这样不会修改熵值。

鉴于此,这就是我所做的:我创建了一个带有平方箱数的一维直方图,并简单地滑动值,以便数字的前半部分对应于神经元1的激活,而后半部分对应于神经元2的激活。在python中:

# Calculate the entropy of a 1D tensor, fuzzing the edges with epsilon to keep numbers
# clean.
def calculate_entropy(y, epsilon):
    clipped = tf.clip_by_value(y, epsilon, 1 - epsilon)
    return -tf.cast(tf.reduce_sum(clipped * tf.log(clipped)), dtype=tf.float32)


# Sandbox for developing calculating the entropies of y
def tf_entropies(y, epsilon, nbins):
    # Create histograms for the activations in the batch.
    value_range = [0.0, 1.0]
    # For prototype, only consider first two features.
    neuron1 = y[:, 0]
    neuron2 = y[:, 1]
    hist1 = tf.histogram_fixed_width(neuron1, value_range, nbins=nbins)
    hist2 = tf.histogram_fixed_width(neuron2, value_range, nbins=nbins)
    # Normalize
    count = tf.cast(tf.count_nonzero(hist1), tf.int32)
    dist1 = tf.divide(hist1, count)
    dist2 = tf.divide(hist2, count)
    neuron1_entropy = calculate_entropy(dist1, epsilon)
    neuron2_entropy = calculate_entropy(dist2, epsilon)

    # Calculate the joint distribution and then get the entropy
    recast_n1 = tf.cast(tf.divide(tf.cast(nbins * neuron1, tf.int32), nbins), tf.float32)
    meshed = recast_n1 + tf.divide(neuron2, nbins)  # Shift over the numbers for neuron2
    joint_hist = tf.histogram_fixed_width(meshed, value_range, nbins=nbins * nbins)
    joint_dist = tf.divide(joint_hist, count)
    joint_entropy = calculate_entropy(joint_dist, epsilon)

    return neuron1_entropy, neuron2_entropy, joint_entropy, joint_dist

一旦获得了关节直方图,就可以使用常规程序来获得关节熵。我通过使用正常的numpy操作实现相同的逻辑来验证是否获得了正确的结果。熵计算结果匹配。

我希望这对其他遇到类似问题的人有帮助。

答案 1 :(得分:0)

也许this被窃取会对您有所帮助。

import tensorflow as tf
@tf.function
def get2dHistogram(x, y,
                   value_range,
                   nbins=100,
                   dtype=tf.dtypes.int32):
    """
    Bins x, y coordinates of points onto simple square 2d histogram

    Given the tensor x and y:
    x: x coordinates of points
    y: y coordinates of points
    this operation returns a rank 2 `Tensor` 
    representing the indices of a histogram into which each element
    of `values` would be binned. The bins are equal width and
    determined by the arguments `value_range` and `nbins`.


  Args:
    x:  Numeric `Tensor`.
    y: Numeric `Tensor`.
    value_range[0] lims for x
    value_range[1] lims for y

    nbins:  Scalar `int32 Tensor`.  Number of histogram bins.
    dtype:  dtype for returned histogram.



    """
    x_range = value_range[0]
    y_range = value_range[1]

    histy_bins = tf.histogram_fixed_width_bins(y, y_range, nbins=nbins, dtype=dtype)

    H = tf.map_fn(lambda i: tf.histogram_fixed_width(x[histy_bins == i], x_range, nbins=nbins),
              tf.range(nbins))
    return H # Matrix!

写在tensorflow 2.0中,但您当然可以管理它。