Question

我已经使用Shiny包在R中编写了一些代码。从RStudio运行shiny::runApp()时，该应用可以正常运行。

我尝试将应用程序托管在Shiny服务器上，并且GUI正确启动。但是，当单击“ Enviar informationacion”按钮时，图应显示在右侧。（您可以看到该应用的外观here，但由于该链接不在Shiny服务器上，而在Shinyapps.io上，因此无法正常工作。）

日志文件的相关部分如下：

Listening on http://127.0.0.1:38327
Loading required package: Rcpp
Warning: Error in [: subscript out of bounds
  211: FUN [/srv/shiny-server/spike_sorting/server.R#82]
  210: apply
  209: cluster_som_h [/srv/shiny-server/spike_sorting/server.R#82]
  ...

因此错误在函数cluster_som_h内部。在尝试了一些东西之后，我发现了导致错误的原因，但不知道如何解决。在此函数内部，我使用了package Rsomoclu中的函数Rsomoclu.train()和kernelType = 1。这意味着该功能在GPU上运行。如果我设置了kernelType = 0，则该应用程序可以与runApp()一起使用，也可以从Shiny服务器上正常工作。这就是问题所在：由于某种原因，如果从Shiny服务器运行该应用程序，则无法在GPU上运行该功能，但是如果使用runApp()从RStudio运行该应用程序，则该功能可以正常工作。

也许是因为我的计算机上安装了CUDA，但正在发生某些事情，但是当我尝试从服务器上运行CUDA时，发生了一些事情。有没有办法来解决这个问题？我相信，无论该应用程序在LAN上的哪个位置运行，都可以从此特定计算机上运行代码可以解决此问题。这可能吗？

Answer 1

进行一些（基本）研究后，我发现了正在发生的事情。我仅在Ubuntu的用户中安装了CUDA，因此我必须更改文件/etc/shiny-server/shiny-server.conf的第一行，以便该用户是正确的用户：

# Instruct Shiny Server to run applications as the user "my_name"
run_as my_name;

在Shiny服务器上运行应用程序时，使用GPU的脚本会引发错误

1 个答案: