从seaborn簇图中提取树状图

Question

给出以下示例，该示例来自：https://python-graph-gallery.com/404-dendrogram-with-heat-map/

它会生成树状图，我认为它是基于scipy的。

# Libraries
import seaborn as sns
import pandas as pd
from matplotlib import pyplot as plt

# Data set
url = 'https://python-graph-gallery.com/wp-content/uploads/mtcars.csv'
df = pd.read_csv(url)
df = df.set_index('model')
del df.index.name
df

# Default plot
sns.clustermap(df)

问题：如何获得非图形形式的树状图？

背景信息： 我想从树状图的根部将其切成最大长度。例如，我们从根到左簇（L）有一条边，从右到右簇（R）有一条边...我想得到它们的边长，并以这两个优势。

最诚挚的问候

Answer 1

clustermap返回ClusterGrid对象的句柄，其中包括每个树状图的子对象， h.dendrogram_col和h.dendrogram_row。 这些内部是树状图本身，提供了树状图几何形状 根据scipy.hierarchical.dendrogram返回数据，您可以从中计算 特定分支的长度。

h = sns.clustermap(df)
dgram = h.dendrogram_col.dendrogram
D = np.array(dgram['dcoord'])
I = np.array(dgram['icoord'])

# then the root node will be the last entry, and the length of the L/R branches will be
yy = D[-1] 
lenL = yy[1]-yy[0]
lenR = yy[2]-yy[3]

链接矩阵（用于计算树状图的输入）可能也有帮助：

h.dendrogram_col.linkage
h.dendrogram_row.linkage