如何在python中比较两个源数据

时间:2018-10-21 11:22:10

标签: python-3.x csv compare pymysql

我有来自2个来源的大型数据集,一个是巨大的文本文件(作为新数据),另一个来自数据库(MySQL)(作为历史数据)。如何比较它们以找出差异(仅获取新记录和修改记录)。我打算读取文本文件中的每一行,并与MySQL中的数据进行比较。

文本文件(demo.txt):

0001|NAME1|A1
0002|NAME2|A2
0003|NAME3|A3
0004|NAME4|A4
0005|NAME5|A1

MySQL中的数据:

id   |   name   |   address
----------------------------
0001 |   NAME1  |   A1
----------------------------
0002 |   NAME2  |   A2
----------------------------
0003 |   NAME3  |   A4
----------------------------
0004 |   NAME4  |   A4
----------------------------

预期结果:

0003|NAME3|A4
0005|NAME5|A1

这是我的努力:

connection = pymysql.connect(host='localhost',
                             user='root',
                             password='password',
                             db='test',
                             charset='utf8',
                             cursorclass=pymysql.cursors.DictCursor)
cursor = connection.cursor()
myfile = open("demo.txt","r")
lines = myfile.readlines()
for line in lines:
    data=line.split('|')
    sql_query = """SELECT * FROM HistoricalTable WHERE id = {}""".format(data[0])
    check=cursor.execute(sql_query)
    result=cursor.fetchall()

    if check>=1:
        for i in result:
            if data[0]==i['id'] and data[1]==i['name'] and data[2]==i['address']:
                print("Ignore")
            else:
                print(line)
                break
    else:
        print(line)

我知道这不是最好的方法,将需要很多时间!所以,请问我有什么建议吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您的问题

我可以确定两个问题: -优化问题, -有关数据集比较的技术问题。

关于优化

最好有一个工作程序,而不是一个不能完美运行的优化程序。 因此,您可能会专注于开发某些功能,然后对其进行优化。

无论如何,如果要在两个数据集中查找重复项,则除非在内存中具有一些可以进一步优化的内在属性(例如,我认为要排序),否则至少需要一个内存中的数据集。

关于查找重复项

例如,较小的数据集可以加载到 iterable 中(例如list),而第二个数据集可以使用生成器函数从文件/数据库中进行迭代。

这是一个演示:

# data1 in memory
data1 = ['a', 'b', 'd', 'c']


# data2 produced by a generator
def item_data2():
    for item in ['a', 'd', 'e', 'c']:
        yield item


duplicates = [x for x in item_data2() if x in data1]
# -> ['a', 'd', 'c']

一些最佳做法

读取CSV文件

要读取CSV文件,可以使用csv库。在特定情况下,您可以使用DictReader

import csv
import io
import os
import pprint

delimiter = '|'
header = "id|name|address".split(delimiter)

data_dir = "path/to/data/directory"

csv_path = os.path.join(data_dir, "source1.csv")

with io.open(csv_path, mode="r", encoding="utf-8") as f:
    reader = csv.DictReader(f, header, delimiter=delimiter)
    for entry in reader:
        pprint.pprint(entry)

# ->
# OrderedDict([('id', '0001'), ('name', 'NAME1'), ('address', 'A1')])
# OrderedDict([('id', '0002'), ('name', 'NAME2'), ('address', 'A2')])
# OrderedDict([('id', '0003'), ('name', 'NAME3'), ('address', 'A3')])
# OrderedDict([('id', '0004'), ('name', 'NAME4'), ('address', 'A4')])
# OrderedDict([('id', '0005'), ('name', 'NAME5'), ('address', 'A1')])

通过 id

为条目建立索引

如果要比较具有相同 id 的数据,可以将数据存储在将 id 和其他文件关联的映射中:

data_mapping = {}
with io.open(csv_path, mode="r", encoding="utf-8") as f:
    reader = csv.DictReader(f, header, delimiter=delimiter)
    for entry in reader:
        data_id = entry.pop('id')
        data_mapping[data_id] = entry

查询数据库

对于数据库,您可以遍历每个记录而不是获取所有记录:您可以使用fetchone。但是,实际上,您可以将游标用作迭代器。

这是一个演示:

import pymysql


connection = pymysql.connect(host='localhost',
                             user='root',
                             password='password',
                             db='test',
                             charset='utf8',
                             cursorclass=pymysql.cursors.DictCursor)

try:
    with connection.cursor() as cursor:
        # Using the cursor as iterator
        cursor.execute("SELECT * FROM HistoricalTable")
        for row in cursor:
            print(row)
finally:
    connection.close()